[發(fā)明專利]利用SSR標(biāo)記快速檢測(cè)低頻外源染色體小片段或基因的方法

無(wú)效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201210399113.4
• 申請(qǐng)日: 2012-10-18
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN102888462A
• 公開(kāi)（公告）日: 2013-01-23
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 宿俊吉;陳紅;相吉山;鄧福軍;吳嫚;甘尚權(quán);劉洋
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 新疆農(nóng)墾科學(xué)院
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68
• 代理公司: 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245
• 代理人: 關(guān)暢;任鳳華

1.一種檢測(cè)待測(cè)樣本中是否含有目的DNA的方法，包括如下步驟：

（a）將N個(gè)待測(cè)樣本按照如式（1）所示的矩陣A進(jìn)行排列；

A=a11a12···a1na21a22···a2n············am1am2···amm]]>

式（1）

（b）混合位于所述矩陣A中每一行的所有所述待測(cè)樣本，共得到m個(gè)行混合樣本；混合位于所述矩陣A中每一列的所有所述待測(cè)樣本，共得到n個(gè)列混合樣本；

（c）分別檢測(cè)步驟（b）所得的m個(gè)行混合樣本和n個(gè)列混合樣本中是否存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物；

（d）將經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物的所有所述行混合樣本對(duì)應(yīng)的混合前所述待測(cè)樣本均進(jìn)行標(biāo)記；將經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物的所有所述列混合樣本對(duì)應(yīng)的混合前所述待測(cè)樣本均進(jìn)行標(biāo)記；

（e）根據(jù)步驟（d）的標(biāo)記結(jié)果，按照如下方法確定所述N個(gè)待測(cè)樣本是否含有目的DNA：

若經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物的所述行混合樣本有且只有1個(gè)，和/或經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物的所述列混合樣本有且只有1個(gè)，則步驟（d）中標(biāo)記過(guò)兩次的所述待測(cè)樣本含有所述目的DNA或候選含有所述目的DNA，其余所有所述待測(cè)樣本不含有所述目的DNA或候選不含有所述目的DNA；

若經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物的所述行混合樣本有2個(gè)以上，同時(shí)經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物的所述列混合樣本有2個(gè)以上，則將步驟（d）中標(biāo)記過(guò)兩次的所述待測(cè)樣本取出，分別檢測(cè)是否存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物，存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物的所述待測(cè)樣本含有所述目的DNA或候選含有所述目的DNA，其余所有所述待測(cè)樣本不含有所述目的DNA或候選不含有所述目的DNA；

若所有所述行混合樣本經(jīng)步驟（c）檢測(cè)不存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物，和/或若所有所述列混合樣本經(jīng)步驟（c）檢測(cè)不存在所述目的DNA的等價(jià)遺傳標(biāo)記物，則所有所述待測(cè)樣本不含有所述目的DNA或候選不含有所述目的DNA；

其中，m和n均為3以上的整數(shù)，N等于m×n。

2.一種檢測(cè)待測(cè)樣本中是否含有目的DNA的方法，包括如下步驟：

（a）將N個(gè)待測(cè)樣本按照如式（1）所示的矩陣A進(jìn)行排列；

A=a11a12···a1na21a22···a2n············am1am2···amm]]>

式（1）

（b）混合位于所述矩陣A中每一行的所有所述待測(cè)樣本，共得到m個(gè)行混合樣本；混合位于所述矩陣A中每一列的所有所述待測(cè)樣本，共得到n個(gè)列混合樣本；

（c）分別檢測(cè)步驟（b）所得的m個(gè)行混合樣本和n個(gè)列混合樣本中是否存在所述目的DNA；

（d）將經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的所有所述行混合樣本對(duì)應(yīng)的混合前所述待測(cè)樣本均進(jìn)行標(biāo)記；將經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的所有所述列混合樣本對(duì)應(yīng)的混合前所述待測(cè)樣本均進(jìn)行標(biāo)記；

（e）根據(jù)步驟（d）的標(biāo)記結(jié)果，按照如下方法確定所述N個(gè)待測(cè)樣本是否含有目的DNA：

若經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的所述行混合樣本有且只有1個(gè)，和/或經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的所述列混合樣本有且只有1個(gè)，則步驟（d）中標(biāo)記過(guò)兩次的所述待測(cè)樣本含有所述目的DNA或候選含有所述目的DNA，其余所有所述待測(cè)樣本不含有所述目的DNA或候選不含有所述目的DNA；

若經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的所述行混合樣本有2個(gè)以上，同時(shí)經(jīng)步驟（c）檢測(cè)存在所述目的DNA的所述列混合樣本有2個(gè)以上，則將步驟（d）中標(biāo)記過(guò)兩次的所述待測(cè)樣本取出，分別檢測(cè)是否存在所述目的DNA，存在所述目的DNA的所述待測(cè)樣本含有所述目的DNA或候選含有所述目的DNA，其余所有所述待測(cè)樣本不含有所述目的DNA或候選不含有所述目的DNA；

若所有所述行混合樣本經(jīng)步驟（c）檢測(cè)均不存在所述目的DNA，和/或若所有所述列混合樣本經(jīng)步驟（c）檢測(cè)均不存在所述目的DNA，則所有所述待測(cè)樣本不含有所述目的DNA或候選不含有所述目的DNA；

其中，m和n均為3以上的整數(shù)，N等于m×n。