[發明專利]一種羅非魚源無乳鏈球菌的高靈敏度快速檢測方法無效
| 申請號: | 201210368104.9 | 申請日: | 2012-09-27 |
| 公開(公告)號: | CN102888458A | 公開(公告)日: | 2013-01-23 |
| 發明(設計)人: | 易弋;楊軍;黃稀;黎婭;伍時華;羅福廣;左躍 | 申請(專利權)人: | 廣西工學院;柳州市魚家樂飼料有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/14 |
| 代理公司: | 柳州市榮久專利商標事務所(普通合伙) 45113 | 代理人: | 周小芹 |
| 地址: | 545006 廣西*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 羅非魚 源無乳 鏈球菌 靈敏度 快速 檢測 方法 | ||
1.一種羅非魚源無乳鏈球菌的高靈敏度快速檢測方法,其特征在于:包括以下步驟:
S1.抽取待檢羅非魚的血液1~2?mL,提取血液中的總RNA;
S2.以所提取的總RNA為模板,進行反轉錄反應,獲得待測羅非魚血液樣品的cDNA;
S3.根據無乳鏈球菌的cfb基因序列設計并合成用于環介導等溫擴增的引物;
S4.以上述步驟S2中獲得的cDNA為模板,利用上述步驟S3中合成的引物,進行目標基因的環介導等溫擴增;
S5.擴增完成后,檢測反應結果,結果陽性的表示供檢羅非魚感染了無乳鏈球菌,結果陰性的表示供檢羅非魚沒有感染無乳鏈球菌。
2.根據權利要求1所述的一種羅非魚源無乳鏈球菌的高靈敏度快速檢測方法,其特征在于:步驟S1中所述的提取羅非魚血液總RNA,具體方法如下:
S11.抽取待檢羅非魚的血液1?mL,將其于轉速為5000?rpm離心10?min,去掉上清液后加入1?mL用于總RNA抽提的trizol試劑,反復吹打重懸沉淀,得重懸液;
S12.將上述步驟S11中所得的重懸液于室溫靜置5min后,每1?mL?trizol加0.2?mL氯仿,用手輕搖3-5次,使得氯仿和trizol試劑混合均勻,在室溫靜置2-3min后,于4-8℃,轉速12000?rpm離心15?min,離心后,溶液分為水層、中間層和氯仿層共3層;
S13.將上述步驟S12中的水層0.4-0.5?mL轉移到一只干凈的1.5?mL離心管中,加入等體積的異丙醇,用手輕搖3-5次混勻,在室溫放置10?min,于4-8℃,轉速12000?rpm離心10?min,離心后棄去上清液,所得沉淀備用;
S14.將上述步驟S13中所獲的沉淀,用1mL濃度為75%乙醇洗滌后,在4-8℃,轉速7500?rpm離心5?min,離心后棄去上清液,所得沉淀即為提取的總RNA;
S15.將上述步驟S14獲得的RNA自然干燥后加入40?μL去RNA酶水進行溶解。
3.根據權利要求1所述的一種羅非魚源無乳鏈球菌的高靈敏度快速檢測方法,其特征在于:步驟S2中所述的以所提取的總RNA為模板,進行反轉錄反應,具體方法如下:
S21.配制反應體系20μL,包括RNA模板1μl,5倍反應緩沖液4μL,濃度為10?mmol/L的dNTP?2μL,濃度為10U/μL?的RNA酶抑制劑2μL,濃度為25μmol/L的隨機引物1μL,濃度為5U/μL的反轉錄酶2μL,添加去RNA酶水至總體積20μL;
上述的5倍反應緩沖液由pH=8.3的Tris-HCl?250?mmol/L,KCl?375?mmol/L,MgCl2?40?mmol/L和DTT?50?mmol/L組成而得;?
S22.輕微混勻通過上述步驟S21所得的反應液,于室溫放置10?min后移入?42℃恒溫槽中保溫1?h;
S23.將經過上述步驟S22的反應液于冰水中冷卻2min完成反轉錄反應,獲得待測羅非魚血液樣品的cDNA。
4.根據權利要求1所述的一種羅非魚源無乳鏈球菌的高靈敏度快速檢測方法,其特征在于:步驟S3中所述的引物是根據GenBank數據庫提供的無乳鏈球菌的cfb基因序列,并結合環介導等溫擴增技術的原理設計并合成,分別是:
P1:?5-ATGAACGTTACACATATGATGT-3;
P2:?5-GTTCCCTGAACATTATCTTTGA-3;
P3:?5-TCAGCATGTACTTCTAATACAGCTGATCTATCTGGAACTCTAGTGG-3;
P4:?5-AGTGACAACTCCACAAGTGGTAGCTATCTTGATCAAGCTTTTGAG-3。
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