[發(fā)明專利]基于耐熱核酸酶HII的單核苷酸多態(tài)性檢測方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210260940.5 | 申請日: | 2012-07-25 |
| 公開(公告)號: | CN103571932A | 公開(公告)日: | 2014-02-12 |
| 發(fā)明(設計)人: | 李玉占 | 申請(專利權(quán))人: | 上海賽弗生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京聯(lián)瑞聯(lián)豐知識產(chǎn)權(quán)代理事務所(普通合伙) 11411 | 代理人: | 曾少麗 |
| 地址: | 200540 上海市金山*** | 國省代碼: | 上海;31 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 耐熱 核酸酶 hii 核苷酸 多態(tài)性 檢測 方法 | ||
1.一種基于耐熱核酸酶HII的單核苷酸多態(tài)性檢測方法,其特征在于,使用耐熱核酸酶HII切斷帶有核糖核苷酸的分子信標,將熒光信號積累下來,檢測雙鏈DNA;其中,所述帶有核糖核苷酸的分子信標為中間帶有一個核糖核酸,兩側(cè)的核苷酸彼此配對,兩側(cè)分別用熒光發(fā)射基團和熒光淬滅基團標記,整個分子信標形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),無熒光釋放出來。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于耐熱核酸酶HII的單核苷酸多態(tài)性檢測方法,其特征在于,所述檢測方法還包括與PCR擴增偶聯(lián)。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的一種基于耐熱核酸酶HII的單核苷酸多態(tài)性檢測方法,其特征在于,所述熒光發(fā)射基團為FAM或TET;所述熒光淬滅基團為DACBYL。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種基于耐熱核酸酶HII的單核苷酸多態(tài)性檢測方法,其特征在于,所述分子信標長33個核苷酸,中間帶有一個核糖核苷酸,中間的21個核苷酸與檢測樣本DNA配對,兩側(cè)的6個核苷酸彼此配對。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種基于耐熱核酸酶HII的單核苷酸多態(tài)性檢測方法,其特征在于,所述分子信標為
Amp-T:
5’FAM-CGCGCCAGTAAGGGAAruAGGAAGTACTGGCGCG-DABCYL、
Amp-A:
5’FAM-CGCGCCAGTAAGGGAAraAGGAAGTACTGGCGCG-DABCYL、
Amp-C:
5’FAM-CGCGCCAGTAAGGGAArcAGGAAGTACTGGCGCG-DABCYL、或
Amp-G:
5’FAM-CGCGCCAGTAAGGGAArgAGGAAGTACTGGCGCG-DABCYL。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于耐熱核酸酶HII的單核苷酸多態(tài)性檢測方法,其特征在于,所述檢測方法具體包括:
步驟Ⅰ,制備中間帶一個核糖核苷酸的分子信標;
步驟Ⅱ,檢測反應體系的建立;
將擴增目標DNA的引物序列、dNTP、Taq?DNA聚合酶、Tth核酸酶HII、分子信標和檢測樣本DNA加入Taq酶催化的反應體系中,配制反應混合物;
步驟Ⅲ,熒光信號放大反應;
將步驟Ⅱ中的反應混合物,放入熒光定量PCR儀中,進行PCR擴增和基因分型檢測;
步驟Ⅳ,確定基因多態(tài)性;
根據(jù)不同樣本間熒光信號的差異,確定檢測樣本待測位點的單核苷酸多態(tài)性。
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