[發(fā)明專利]與中國荷斯坦奶牛產(chǎn)奶性狀相關(guān)的SNP標(biāo)記及其應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210175477.4 | 申請日: | 2012-05-30 |
| 公開(公告)號: | CN102676514A | 公開(公告)日: | 2012-09-19 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 張勤;劉劍鋒;張勝利;王海飛;趙紅梅 | 申請(專利權(quán))人: | 中國農(nóng)業(yè)大學(xué) |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飛;王加嶺 |
| 地址: | 100193 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 中國 斯坦 奶牛 性狀 相關(guān) snp 標(biāo)記 及其 應(yīng)用 | ||
1.一種與中國荷斯坦奶牛產(chǎn)奶性狀相關(guān)的SNP標(biāo)記,其特征在于,其位于中國荷斯坦奶牛PTK2基因如SEQ?ID?NO.1所示序列的227bp處,此處堿基為T的中國荷斯坦奶牛的產(chǎn)奶量、乳蛋白含量顯著高于此處堿基為G的中國荷斯坦奶牛,而乳脂率前者顯著低于后者。
2.用于檢測權(quán)利要求1所述與中國荷斯坦奶牛產(chǎn)奶性狀相關(guān)的SNP標(biāo)記的引物,其特征在于,包括正向引物F5’-TCTGAATCTGCCTCATAAC-3’和反向引物R5′-CTGCTCCGTCTGTGCT-3′。
3.權(quán)利要求1所述與中國荷斯坦奶牛產(chǎn)奶性狀相關(guān)的SNP標(biāo)記在鑒定產(chǎn)奶量高的中國荷斯坦奶牛優(yōu)勢品種中的應(yīng)用,其包括步驟:
1)提取待測中國荷斯坦奶牛的基因組DNA;
2)以待測中國荷斯坦奶牛的基因組DNA為模版,利用權(quán)利要求2所述引物F和R,通過PCR反應(yīng)擴(kuò)增出中國荷斯坦奶牛PTK2基因496bp片段;
3)檢測PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,如果擴(kuò)增產(chǎn)物序列中227bp處的堿基為T,則待測中國荷斯坦奶牛屬于產(chǎn)奶量高的中國荷斯坦奶牛優(yōu)勢品種。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用,其特征在于,步驟2)中PCR反應(yīng)使用的擴(kuò)增體系以25μl計為:50ng/μl模板DNA1μl,10pmol/d引物F和R各1μl,10mmol/L?dNTP?mix2.0μl,5U/μL?Taq?DNA聚合酶0.125μl,10×PCR反應(yīng)緩沖液2.5μl,余量為水。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應(yīng)用,其特征在于,步驟2)中PCR反應(yīng)使用的條件為:94℃5分鐘;94℃30秒,47.5℃35秒,72℃35秒,34個循環(huán);72℃10分鐘。
6.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用,其特征在于,步驟3)中檢測PCR擴(kuò)增產(chǎn)物采用RFLP法,具體為:用內(nèi)切酶NlaIII對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行酶切,并對酶切產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測,如果檢測結(jié)果僅為一條帶,則待測中國荷斯坦奶牛屬于產(chǎn)奶量高的中國荷斯坦奶牛優(yōu)勢品種,檢測結(jié)果出現(xiàn)兩條帶,則待測中國荷斯坦奶牛屬于普通品種。
7.含有權(quán)利要求2所述引物的用于檢測中國荷斯坦奶牛產(chǎn)奶性狀的試劑盒。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括dNTPs、Taq?DNA聚合酶、Mg2+、PCR反應(yīng)緩沖液中的一種或多種。
9.根據(jù)權(quán)利要求7或8所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括標(biāo)準(zhǔn)陽性模板。
10.權(quán)利要求1所述與中國荷斯坦奶牛產(chǎn)奶性狀相關(guān)的SNP標(biāo)記在中國荷斯坦奶牛分子標(biāo)記輔助育種中的應(yīng)用。
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