[發明專利]一種用于動物個體身份識別和/或肉產品溯源的條形碼編制方法及其應用

有效

• 申請號: 201210137233.7
• 申請日: 2012-05-04
• 公開（公告）號: CN102682322A
• 公開（公告）日: 2012-09-19
• 發明（設計）人: 邢光東;胡肄農;趙慶順;顧洪如;王曉曉;朱振坤;施振旦
• 申請（專利權）人: 江蘇省農業科學院
• 主分類號: G06K19/06
• 分類號: G06K19/06
• 代理公司: 南京天華專利代理有限責任公司 32218
• 代理人: 徐冬濤;傅婷婷

技術領域

本發明屬于分子生物學領域，涉及一種用于動物個體身份識別和/或肉產品溯源的條形碼編制方法及其應用。

背景技術

豬肉是我國居民消費的最主要肉類產品，我國也是生產和消費豬肉量最大的國家。食品安全近年頻發，已成為輿論焦點。建立可靠的豬肉產品溯源系統，實現豬場到餐桌全程雙向可追溯，對獸藥殘留、瘦肉精、重金屬濫用等問題豬肉生產的遏制，傳染性疾病，特別是人畜共患病傳染性疾病的切斷及處理，市場消費信心的培育，養豬業的健康發展等，起至關重要的作用。

豬肉產品溯源的技術方法很多，由于技術簡單、低成本及實際操作簡易，目前大都采用耳標等標簽溯源技術，但缺點是標簽易丟失、受損、易混淆，易在豬活體、胴體和豬肉產品間分離，且缺乏可信度。DNA溯源技術基于基因組DNA的遺傳與變異，目前用于肉產品溯源技術主要是AFLP、SSR及SNP三種。其中，SNP（single-nucleotide?polymorphism，單核苷酸多態性）標記是第三代溯源技術。SNP是指同一物種不同成員間或同一個體的成對染色體在同一基因組DNA位點上出現的單個核苷酸之間的變異。例如，如果來自不同個體的同一基因組位點DNA片段序列分別為AAGCCTA和AAGCTTA,則此段DNA片段序列就存在一個SNP位點，等位基因為C和T。幾乎所有常見的SNP均只有兩個等位基因，但就個體而言，其成對染色體可能為不同的等位基因。因此，群體中一個常見的SNP位點通常存在三種基因型。以上述SNP為例，其群體中存在的基因型一般為C/C（個體的兩條染色體上的等位基因均為C）、T/T（個體的兩條染色體上的等位基因均為T）和T/C（個體的兩條染色體上的等位基因分別為C和T）。相對而言，基因編碼區比非編碼區在進化上存在更大的壓力，因此SNP通常出現在非編碼區。由于種群的地理隔絕，可導致SNP在不同種群中的頻率不同，一個在某個地理種群或種族中常見的SNP等位基因可能極少出現在另一個種群或種族內。再者，SNP是可遺傳的變異中最常見的一種，具有分布廣、密度高的特點，基因組DNA中平均約每1000bp，甚至高突變區段每200-300bp就存在1個SNP位點，因此，SNP常被開發為DNA指紋，用于動物的個體身份認證，因此研發豬個體身份識別或豬肉產品溯源的SNP條形碼及相應的數字條形碼意義重大。

發明內容

本發明的目的提供一種用于動物個體身份識別和/或肉產品溯源的條形碼編制方法。

本發明的另一目的在于提供利用該方法編制的條形碼。

本發明的又一目的是提供該條形碼編制方法的應用。

本發明的目的可通過如下技術方案實現：

一種用于動物個體身份識別和/或肉產品溯源的條形碼編制方法，選擇待識別動物或待溯源肉產品的基因組DNA上的高雜合度的SNP位點并組合成SNP條形碼，然后用十種阿拉伯數字0～9隨機唯一的替代SNP條形碼中的10種SNP基因型：A/A、T/T、G/G、C/C、A/T、A/G、A/C、T/G、T/C、G/C，形成相應的數字條形碼，實現動物個體身份與SNP條形碼以及數字條形碼的一一對應。

所述的高雜合度SNP位點優選雜合度大于等于0.1的SNP位點。

所述的高雜合度SNP位點是根據GenBank登錄的待識別動物或待溯源肉產品的基因組DNA序列設計引物，以待識別動物或待溯源肉產品基因組DNA為模板，進行PCR擴增，擴增產物測序，并篩選雜合度大于等于0.1的SNP位點。

所述的動物優選豬，所述的肉產品優選豬肉。

所述的豬或豬肉產品的基因組DNA上的高雜合度的SNP位點優選根據GenBank登錄的豬基因組DNA序列設計引物對1～7，以豬基因組DNA為模板，進行PCR擴增，擴增產物測序，并篩選雜合度大于等于0.1的SNP位點；其中所述的引物對1的正向引物為SEQ?ID?No.1，反向引物為SEQ?ID?No.2；所述的引物對2的正向引物為SEQ?ID?No.3，反向引物為SEQ?ID?No.4；所述的引物對3的正向引物為SEQ?ID?No.5，反向引物為SEQ?ID?No.6；所述的引物對4的正向引物為SEQ?ID?No.7，反向引物為SEQ?ID?No.8；所述的引物對5的正向引物為SEQID?No.9，反向引物為SEQID?No.10；所述的引物對6的正向引物為SEQ?ID?No.11，反向引物為SEQ?ID?No.12；所述的引物對7的正向引物為SEQ?ID?No.13，反向引物為SEQ?ID?No.14。