[發明專利]ncRNA及其用途

有效

• 申請號: 201180065510.1
• 申請日: 2011-11-17
• 公開（公告）號: CN103403181A
• 公開（公告）日: 2013-11-20
• 發明（設計）人: A.錢奈彥;J.普倫斯納;M.艾爾
• 申請（專利權）人: 密執安大學評議會
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;G01N33/574;C12N15/113
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 龐立志;梁謀

本申請要求于2010年11月19日提交的臨時申請61/415,490的優先權，該臨時申請整體以引用方式并入本文。

關于聯邦資助研發項目的聲明

本發明根據美國國立衛生研究院(National?Institutes?of?Health)授予的CA069568、CA132874和CA111275以及美國陸軍醫學研究和物資司令部(Army?Medical?Research?and?Material?Command)授予的W81XWH-09-2-0014在政府支持下完成。政府享有本發明的某些權利。

發明領域

本發明涉及用于癌癥診斷、研究和治療的組合物和方法，包括但不限于癌癥標志物。具體地講，本發明涉及作為前列腺癌、肺癌、乳腺癌和胰腺癌的診斷標志物和臨床靶標的ncRNA。

發明背景

癌癥研究的一個中心目標是識別與癌發生存在因果關系的改變的基因。已識別出了多種類型的體細胞突變，包括堿基置換、插入、缺失、易位以及染色體獲得和丟失，所有這些都會導致致癌基因或腫瘤抑制基因的活性改變。在20世紀早期首先提出假設，現在已經存在有說服力的證據表明染色體重排在癌癥中的因果作用(Rowley,?Nat?Rev?Cancer?1:?245?(2001))。經常性染色體畸變被認為主要為白血病、淋巴瘤和肉瘤所特有。更為常見并且造成與人癌癥相關的發病率和死亡率的相對大比例的上皮瘤（癌）包含低于1%的已知、疾病特異性的染色體重排(Mitelman,?Mutat?Res?462:?247?(2000))。雖然血液惡性腫瘤的特征通常在于平衡的、疾病特異性的染色體重排，但是大部分實體瘤都具有過多的非特異性染色體畸變。據認為，實體瘤的核型復雜性是由于通過癌演化或進展獲得的繼發改變而造成。

染色體重排的兩種主要機制已有描述。在一種機制中，鄰近原癌基因的一個基因的啟動子/增強子元件發生重排，從而導致原癌蛋白的表達改變。這種類型的易位的示例為免疫球蛋白(IG)和T細胞受體(TCR)基因與MYC并置，從而分別導致B細胞和T細胞惡性腫瘤中該致癌基因的活化(Rabbitts,?Nature?372:?143?(1994))。在第二種機制中，重排導致兩種基因的融合，其產生可具有新功能或改變的活性的融合蛋白。此易位的原型實例為慢性骨髓性白血病(CML)中的BCR-ABL基因融合(Rowley,?Nature?243:?290?(1973);?de?Klein等,?Nature?300:?765?(1982))。重要的是，此發現導致了合理地開發甲磺酸伊馬替尼（格列衛(Gleevec)），其成功地靶向了BCR-ABL激酶(Deininger等,?Blood?105:?2640?(2005))。因此，需要特異性識別上皮瘤的診斷方法。

發明概要

本發明涉及用于癌癥診斷、研究和治療的組合物和方法，包括但不限于癌癥標志物。具體地講，本發明涉及作為前列腺癌、肺癌、乳腺癌和胰腺癌的診斷標志物和臨床靶標的ncRNA。

本發明的實施方案提供可用于檢測和篩查前列腺癌的組合物、試劑盒和方法。在本發明實施方案的開發過程中進行的實驗識別出了前列腺癌中非編碼RNA的上調。本發明的一些實施方案提供用于檢測此類ncRNA的表達水平的組合物和方法。ncRNA的識別可用于篩查、診斷和研究用途。