[發明專利]鹽霉素的生物合成基因簇及其應用

在審

• 申請號: 201110397282.X
• 申請日: 2011-12-02
• 公開（公告）號: CN103131716A
• 公開（公告）日: 2013-06-05
• 發明（設計）人: 白林泉;姜春艷;王后根
• 申請（專利權）人: 上海交通大學
• 主分類號: C12N15/31
• 分類號: C12N15/31;C12N15/52;C12N9/00;C12N15/63;C12N1/20;C12N5/10;C12N1/15;C12N1/19;C12N1/21;C12P17/18;C07K14/36;C12R1/47
• 代理公司: 上海一平知識產權代理有限公司 31266
• 代理人: 祝蓮君;雷芳

1.一種鹽霉素的生物合成基因簇，其特征在于，所述基因簇包括編碼鹽霉素生物合成所涉及的30個基因，具體為：

1)負責鹽霉素生物合成的基因，即slnA1，slnA2，slnA3，slnA4，slnA5，slnA6，slnA6，slnA7，slnA8，slnA9，slnBI，slnBII，slnBIII，slnC，slnDI，slnDII，slnE，slnF；共17個基因：

slnA1位于基因簇核苷酸序列第13658～28435位，編碼典型的I型聚酮合酶，長度為4925個氨基酸；

slnA2位于基因簇核苷酸序列第28468～40221位，編碼典型的I型聚酮合酶，長度為3917個氨基酸；

slnA3位于基因簇核苷酸序列第40244～48322位，編碼典型的I型聚酮合酶，長度為2692個氨基酸；

slnA4位于基因簇核苷酸序列第48450～53378位，編碼典型的I型聚酮合酶，長度為1642個氨基酸；

slnA5位于基因簇核苷酸序列第53431～64683位，編碼典型的I型聚酮合酶，長度為3750個氨基酸；

slnA6位于基因簇核苷酸序列第64789～69105位，編碼典型的I型聚酮合酶，長度為1435個氨基酸；

slnA7位于基因簇核苷酸序列第69148～74082位，編碼典型的I型聚酮合酶，長度為1644個氨基酸；

slnA8位于基因簇核苷酸序列第74150～85324位，編碼典型的I型聚酮合酶，長度為3724個氨基酸；

slnA9位于基因簇核苷酸序列第85352～92290位，編碼典型的I型聚酮合酶，長度為2312個氨基酸；

slnBI位于基因簇核苷酸序列第92379～92765位，編碼環氧化水解酶，長度為128個氨基酸；

slnBII位于基因簇核苷酸序列第99550～99101位，編碼環氧化水解酶，長度為149個氨基酸；

slnBIII位于基因簇核苷酸序列第100004～99543位，編碼環氧化水解酶，長度為153個氨基酸；

slnC位于基因簇核苷酸序列第100184～101638位，編碼環氧化酶，長度為484個氨基酸；

slnDI位于基因簇核苷酸序列第92807～93604位，編碼II型硫酯酶，長度為265個氨基酸；

slnDII位于基因簇核苷酸序列第105116～105877位，編碼II型硫酯酶，長度為253個氨基酸；

slnE位于基因簇核苷酸序列第94936～94655位，編碼鐵氧還蛋白，長度為93個氨基酸；

slnF位于基因簇核苷酸序列第96156～94933位，編碼細胞色素P450單加氧酶，長度為407個氨基酸；

2)負責鹽霉素生物合成的調節基因，即slnR，共1個基因；

slnR位于基因簇核苷酸序列第102168～104888位，編碼LuxR家族轉錄調控蛋白，長度為906個氨基酸；

3)抗生素轉運相關基因，slnTI，slnTII，共2個基因；

slnTI位于基因簇核苷酸序列第96333～97292位，編碼ABC轉運蛋白，長度為319個氨基酸；

slnTII位于基因簇核苷酸序列第97289～98929位，編碼ABC轉運蛋白，長度為546個氨基酸；

4)其它基因，即slnM，orf11，orf12，orf13，orf14，orf15，orf16，orf17，orf18，orf19，共10個基因；

slnM位于基因簇核苷酸序列第93645～94460位，編碼O-甲基轉移酶，長度為271個氨基酸；

orf11位于基因簇核苷酸序列第12329～10611位，編碼3-羥基丁酰輔酶A脫氫酶，長度為572個氨基酸；

orf12位于基因簇核苷酸序列第13354～12326位，編碼3-草乙酰-乙酰載體蛋白合成酶，長度為342個氨基酸；

orf13位于基因簇核苷酸序列第106029～108617位，編碼多肽合成酶，長度為862個氨基酸；

orf14位于基因簇核苷酸序列第108927～108679位，編碼未知功能蛋白，長度為82個氨基酸；

orf15位于基因簇核苷酸序列第111671～109104位，編碼SARP家族轉錄調控蛋白，長度為855個氨基酸；

orf16位于基因簇核苷酸序列第111987～113780位，編碼包含AMP結合結構域的蛋白，長度為597個氨基酸；

orf17位于基因簇核苷酸序列第113774～115492位，編碼乙酰輔酶A脫氫酶，長度為572個氨基酸；

orf18位于基因簇核苷酸序列第115524～115814位，編碼多肽載體蛋白，長度為96個氨基酸；

orf19位于基因簇核苷酸序列第115811～116650位，編碼4′-磷酸泛酰巰基乙胺轉移酶，長度為279個氨基酸。