[發(fā)明專利]用于檢測EGFR外顯子21多態(tài)性的引物組及其應用

在審

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• 申請日: 2011-10-28
• 公開（公告）號: CN102453764A
• 公開（公告）日: 2012-05-16
• 發(fā)明（設計）人: 井口亞希
• 申請（專利權(quán)）人: 愛科來株式會社
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京東方億思知識產(chǎn)權(quán)代理有限責任公司 11258
• 代理人: 肖善強

1.用于檢測EGFR外顯子21中多態(tài)性的引物組，所述引物組包含P1寡核苷酸和P2寡核苷酸，并且所述引物組能夠通過使用SEQ?ID?NO：1中的區(qū)域作為模板進行擴增，所述區(qū)域包含SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基，

所述P1寡核苷酸具有10個堿基到50個堿基的長度，并且具有胞嘧啶作為與SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基互補的堿基，

所述P2寡核苷酸具有10個堿基到50個堿基的長度，并且具有腺嘌呤作為與SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基互補的堿基，和

所述P1寡核苷酸和所述P2寡核苷酸滿足下述相關(guān)性中的至少一種：所述P1寡核苷酸的解鏈溫度高于P2寡核苷酸的解鏈溫度；或所述P1寡核苷酸比P2寡核苷酸長一個或多個堿基。

2.權(quán)利要求1所述的引物組，其中所述P1寡核苷酸或P2寡核苷酸中的至少一個在不同于與SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基互補的堿基位置的位置包含至少一個與SEQ?ID?NO：1的堿基序列不互補的堿基。

3.權(quán)利要求1所述的引物組，其中所述P1寡核苷酸或P2寡核苷酸中的至少一個在不同于與SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基互補的堿基位置的位置包含額外的序列，所述額外的序列由連續(xù)的2到10個不與SEQ?IDNO：1的堿基序列互補的堿基形成，并且位于寡核苷酸鏈的5′末端。

4.權(quán)利要求1所述的引物組，其中所述P1寡核苷酸或P2寡核苷酸中的至少一個在同于與SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基互補的堿基位置的位置包含錯配堿基或包含與SEQ?ID?NO：1的堿基序列不互補的2到20個錯配堿基的序列。

5.權(quán)利要求1所述的引物組，其中所述P1寡核苷酸或P2寡核苷酸中的至少一個在從其3′末端起的第1位到第3位中的一處包含與SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基互補的堿基。

6.權(quán)利要求1所述的引物組，其中所述P1寡核苷酸的解鏈溫度比所述P2寡核苷酸的解鏈溫度高0.1℃到20℃。

7.權(quán)利要求1所述的引物組，所述引物組還包含與下述序列同源的引物，所述序列處于位于SEQ?ID?NO：1堿基序列中的模板核酸序列的5′末端側(cè)的區(qū)域中，其中所述模板核酸序列與所述P1寡核苷酸或P2寡核苷酸互補。

8.權(quán)利要求1所述的引物組，所述引物組包含SEQ?ID?NO：2到SEQID?NO：11的寡核苷酸中的至少一個作為P1寡核苷酸，和SEQ?ID?NO：12到SEQ?ID?NO：21的寡核苷酸中的至少一個作為P2寡核苷酸。

9.用于檢測EGFR外顯子21中多態(tài)性的引物，所述引物能夠通過使用SEQ?ID?NO：1中的區(qū)域作為模板進行擴增，所述區(qū)域包含SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基，并且，所述引物是下述寡核苷酸，所述寡核苷酸具有10個堿基到50個堿基的長度，并且具有胞嘧啶作為與SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基互補的堿基。

10.權(quán)利要求9所述的引物，所述引物在不同于與SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基互補的堿基位置的位置包含至少一個與SEQ?ID?NO：1的堿基序列不互補的堿基。

11.權(quán)利要求9所述的引物，所述引物在不同于與SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基互補的堿基位置的位置包含一個或多個與SEQ?ID?NO：1的堿基序列不互補的堿基，所述一個或多個不互補的堿基選自由下組，所述組由：

額外的序列，所述序列由連續(xù)的2到10個堿基形成，且位于所述引物5′末端；

錯配堿基；和

2到20個錯配堿基的序列

組成。

12.權(quán)利要求9所述的引物，所述引物在從其3′末端起的第1位到第3位中的一處包含與SEQ?ID?NO：1的第172792個堿基互補的堿基。