[發(fā)明專利]氟喹諾酮類抗菌藥基于理化性質(zhì)的藥時(shí)曲線預(yù)測模型有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201110334628.1 | 申請(qǐng)日: | 2011-10-28 |
| 公開(公告)號(hào): | CN102663218B | 公開(公告)日: | 2017-12-19 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 孫鶴;陳紅燕 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 天津大學(xué) |
| 主分類號(hào): | G06F19/00 | 分類號(hào): | G06F19/00 |
| 代理公司: | 天津市北洋有限責(zé)任專利代理事務(wù)所12201 | 代理人: | 宋潔瑾 |
| 地址: | 300072*** | 國省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 喹諾酮類 抗菌 基于 理化 性質(zhì) 曲線 預(yù)測 模型 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及人體藥代動(dòng)力學(xué)參數(shù)的預(yù)測方法,更具體地說,是構(gòu)建通過喹諾酮類抗菌藥理化性質(zhì)達(dá)到快速預(yù)測人體內(nèi)藥時(shí)曲線(AUC)的模型。
背景技術(shù)
對(duì)氟喹諾酮類化合物進(jìn)行結(jié)構(gòu)修飾以獲得活性更強(qiáng)、抗菌譜更廣、毒性更小的新氟喹諾酮類一直是抗菌藥物研究領(lǐng)域的重要課題之一,但受到該類藥物高昂的開發(fā)費(fèi)用和較長的開發(fā)周期所限制;并且很多在體外具有良好抗菌活性的氟喹諾酮類先導(dǎo)物,均因藥動(dòng)學(xué)參數(shù)不佳或者不良反應(yīng)太大而被淘汰。AUC是表征此類藥物在體內(nèi)吸收程度的一個(gè)重要的指標(biāo),是進(jìn)行人體I期臨床試驗(yàn)所必須測定的一個(gè)藥動(dòng)學(xué)參數(shù)。獲得良好的AUC對(duì)于此類藥物的研發(fā)具有重要的意義。對(duì)于該指標(biāo)的測定,背景技術(shù)主要是通過臨床試驗(yàn)獲得。對(duì)于這種傳統(tǒng)的研究方法,一旦發(fā)現(xiàn)藥物的AUC達(dá)不到類藥性的要求,則很有可能導(dǎo)致該化合物前期的合成、動(dòng)物試驗(yàn)以及在人體上的試驗(yàn)所付出的時(shí)間及金錢的浪費(fèi)。研究證明,藥物的分子結(jié)構(gòu)與其體內(nèi)的吸收、分布、排泄和代謝等藥動(dòng)學(xué)過程密切相關(guān)。因此,在新藥設(shè)計(jì)和開發(fā)的早期對(duì)此類藥物AUC的預(yù)測可望有效加速此類藥物的研發(fā)。現(xiàn)有文獻(xiàn)關(guān)于氟喹諾酮類抗菌藥的AUC的預(yù)測方法見周魯,夏昆華,喹諾酮類化合物的定量構(gòu)動(dòng)關(guān)系,華西藥學(xué)雜志,2006,2(5):433~435,以及Cheng D,Xu WR,Liu CX.Relationship of quantitative structure and pharcokineticsin fluroquinolone antibacterials,World Journal of Gastroenterology,2007,13(7):2496~2503。周魯?shù)炔捎蒙窠?jīng)網(wǎng)絡(luò)法對(duì)AUC的預(yù)測結(jié)果能較好地與試驗(yàn)數(shù)據(jù)相吻合,雖然其計(jì)算結(jié)果能夠?yàn)猷Z酮類化合物新藥的設(shè)計(jì)提供一定的理論依據(jù),給出了喹諾酮類化合物具備較好AUC時(shí)應(yīng)具備的理化性質(zhì)參數(shù)的范圍,包括疏水性參數(shù)logP在-3.5~0.5之間、分子體積在500~600之間、水合能在100~115kal·mol-1左右、偶極矩在5~10D之間、7-位取代基凈電荷QR7在0.1~0.4e以及分子最高占據(jù)軌道能量EHOMO但在-8.2~-0.97eV之間,但其計(jì)算復(fù)雜且不能解釋影響構(gòu)動(dòng)關(guān)系的因素,即難以指導(dǎo)新藥的分子結(jié)構(gòu)的改造;Cheng D等采用遺傳算法篩選變量、偏最小二乘法(PLS)建立的AUC多元線性回歸模型能夠從理論上位指導(dǎo)氟喹諾酮類新藥的設(shè)計(jì),即氟喹諾酮類母核7位上的取代基的體積越小,極化率越大以及表面積越大利于此類新藥的研發(fā)。進(jìn)一步,該模型能夠從分子結(jié)構(gòu)上指導(dǎo)該類化合物的設(shè)計(jì)與改造。模型預(yù)測值與實(shí)驗(yàn)值的相關(guān)性為0.736。但由于僅僅考慮了氟喹諾酮類化合物1位與7位取代基的性質(zhì)對(duì)AUC的影響,在實(shí)際的案例預(yù)測中發(fā)現(xiàn)模型預(yù)測值與實(shí)驗(yàn)值的殘差相關(guān)性相對(duì)較大,其中tusofuloxacin的AUC預(yù)測殘差接近實(shí)驗(yàn)值的4倍。并且遺傳算法及PLS等需要大量數(shù)學(xué)計(jì)算和相關(guān)程序,因此可能不便于實(shí)際中的應(yīng)用推廣。
發(fā)明內(nèi)容
為了解決現(xiàn)有技術(shù)中存在的問題,本發(fā)明提供一種氟喹諾酮類抗菌藥基于理化性質(zhì)的藥時(shí)曲線預(yù)測模型,解決現(xiàn)有技術(shù)中氟喹諾酮類抗菌藥藥時(shí)曲線預(yù)測不準(zhǔn)確,預(yù)測方法繁瑣的問題。
本發(fā)明的技術(shù)方案是:
一種氟喹諾酮類抗菌藥基于理化性質(zhì)的藥時(shí)曲線預(yù)測模型,所述預(yù)測模型采用逐步多元線性回歸結(jié)合曲線擬合的方法構(gòu)建,包括如下步驟:
(1)散點(diǎn)矩陣圖分析;通過SPSS軟件中的Scatter plot構(gòu)建因變量AUC與8個(gè)自變量分子摩爾質(zhì)量MW,分子摩爾體積MV,極性表面積FPSA,水溶性logS,脂水分配系數(shù)logP,pH7.0下的脂水分布系數(shù)logD7.0,3位羧基的酸性解離度pKa1以及7位取代基的堿性解離度pKa2的散點(diǎn)矩陣圖;
(2)FPSA與AUC的曲線擬合,通過SPSS的Curve Estimation對(duì)AUC與FPSA進(jìn)行11常用模型曲線擬合;
(3)pKa2與AUC的曲線擬合,通過SPSS的Curve Estimation對(duì)AUC與pKa2進(jìn)行11常用模型曲線擬合;
(4)自變量相關(guān)性分析,通過SPSS的Bivariate Correlation對(duì)8個(gè)自變量進(jìn)行Pearson相關(guān)性分析;
(5)AUC模型的構(gòu)建。
所述步驟(5)AUC模型的構(gòu)建包括如下步驟:
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G06F 電數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)處理
G06F19-00 專門適用于特定應(yīng)用的數(shù)字計(jì)算或數(shù)據(jù)處理的設(shè)備或方法
G06F19-10 .生物信息學(xué),即計(jì)算分子生物學(xué)中的遺傳或蛋白質(zhì)相關(guān)的數(shù)據(jù)處理方法或系統(tǒng)
G06F19-12 ..用于系統(tǒng)生物學(xué)的建模或仿真,例如:概率模型或動(dòng)態(tài)模型,遺傳基因管理網(wǎng)絡(luò),蛋白質(zhì)交互作用網(wǎng)絡(luò)或新陳代謝作用網(wǎng)絡(luò)
G06F19-14 ..用于發(fā)展或進(jìn)化的,例如:進(jìn)化的保存區(qū)域決定或進(jìn)化樹結(jié)構(gòu)
G06F19-16 ..用于分子結(jié)構(gòu)的,例如:結(jié)構(gòu)排序,結(jié)構(gòu)或功能關(guān)系,蛋白質(zhì)折疊,結(jié)構(gòu)域拓?fù)洌媒Y(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的藥靶,涉及二維或三維結(jié)構(gòu)的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)的,例如:基因型–表型關(guān)聯(lián),不均衡連接,種群遺傳學(xué),結(jié)合位置鑒定,變異發(fā)生,基因型或染色體組的注釋,蛋白質(zhì)相互作用或蛋白質(zhì)核酸的相互作用





