[發明專利]藥物的篩選方法以及藥物組合設計方法

無效

• 申請號: 201110185783.1
• 申請日: 2011-07-05
• 公開（公告）號: CN102289606A
• 公開（公告）日: 2011-12-21
• 發明（設計）人: 熊江輝;梁峰吉;李瑩輝;陳善廣;王晨;劉長寧;楊正茂;魏維
• 申請（專利權）人: 中國航天員科研訓練中心
• 主分類號: G06F19/18
• 分類號: G06F19/18
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種對疾病篩選候選藥物的方法，所述方法包括步驟：

1)選擇一種物種中與所述疾病相關的基因，建立基因協同網絡，其中基因形成所述網絡的節點，基因之間有關聯則在相應基因節點間形成連線；

2)將候選藥物處理所述物種的生物體、部分或樣品，選擇可被該藥物直接或間接擾動的基因，即經藥物處理后表達或量變化的基因或基因產物，或者與該藥物敏感性統計相關的基因；

3)在上述網絡中，標注所述被擾動的基因或產物對應的節點；計算藥物對各個基因的擾動值D_i：如果一個基因被擾動，計數為1，否則為0；計算藥物對各條邊，也即節點間連線的擾動值D_j，如果一個邊連接基因X和基因Y，只有基因X和基因Y的擾動值同時為1，該條邊的擾動值才為1，否則為0；

4)計算所述藥物的對所述基因網絡的擾動效率E：

E=Σj=1NDjΣi=1MDi]]>

其中，設網絡中共有M個基因節點，共有N條邊，D_i為第i個基因的擾動值，D_j為第j條邊的擾動值，上式中，分子為所有邊的擾動值之和；分母為所有基因節點的擾動值之和，

其中，如果擾動效率大于0.005，則所述藥物是所述疾病的候選藥物。

2.一種對疾病篩選已知藥物的配伍候選藥物的方法，所述方法包括步驟：

1)選擇一種物種中與所述疾病相關的基因，建立基因協同網絡，其中基因形成所述網絡的節點，基因之間有關聯則在相應基因節點間形成連線；

2)將已知藥物處理所述物種的生物體、部分或樣品，選擇可被該藥物直接或間接擾動的基因，即經藥物處理后表達或量變化的基因或基因產物，或者與該藥物敏感性統計相關的基因；

3)將候選藥物處理所述物種的生物體、部分或樣品，選擇可被該藥物直接或間接擾動的基因，即經藥物處理后表達或量變化的基因或基因產物，或者與該藥物敏感性統計相關的基因；

4)將所述已知藥物與候選藥物擾動的基因進行合并，在所述網絡中，標注所述被擾動的基因或產物對應的節點；計算藥物對各個基因的擾動值(D_i)：如果一個基因被擾動，計數為1，否則為0；計算藥物對各條邊(節點間連線)的擾動值(D_j)，如果一個邊連接基因X和基因Y，只有基因X和基因Y的擾動值同時為1，該連線(邊)的擾動值才為1，否則為0；

5)計算所述藥物組合對所述基因網絡的擾動效率(E)：

E=Σj=1NDjΣi=1MDi]]>

其中，設網絡中共有M個基因節點，共有N條邊，D_i為第i個基因的擾動值，D_j為第j條邊的擾動值，上式中，分子為所有邊的擾動值之和；分母為所有基因節點的擾動值之和，

其中，藥物組合擾動效率大于0.005表示所述候選藥物可與所述已知藥物配伍。