[發明專利]與谷子育性基因緊密連鎖的分子標記SIsv0057

有效

• 申請號: 201110147547.0
• 申請日: 2011-06-02
• 公開（公告）號: CN102220321A
• 公開（公告）日: 2011-10-19
• 發明（設計）人: 張耕耘;全志武;夏秋菊;倪雪梅
• 申請（專利權）人: 深圳華大基因科技有限公司
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12N15/63;C12N1/15;C12N1/19;C12N1/21;C12N5/10;C12Q1/68
• 代理公司: 深圳鼎合誠知識產權代理有限公司 44281
• 代理人: 羅瑤

技術領域

本發明屬于分子生物學領域，涉及一種分子標記，特別是涉及一種與谷子育性基因緊密連鎖的分子標記。本發明還涉及擴增該分子標記的引物、該分子標記和引物在谷子育性基因定位或谷子遺傳育種中的用途。

背景技術

我國是谷子(Setaria?italica?L.Beauv.)的原產國，是世界上谷子的集中種植國，谷子在我國的國民經濟和社會生產中占有重要的地位，對旱作生態農業建設有重要意義。因此，加速谷子的育種進程尤為重要。由于谷子只是區域重要性作物，因此當前有關谷子的研究手段和方法相對較落后，如何應用先進科學的研究手段搞好谷子育種是一個嚴峻的問題。隨著分子生物學的發展，分子標記技術的出現，為谷子的遺傳研究及育種開辟了新的思路和手段。開發具有我國特色的重要性狀基因的分子標記并進行輔助選擇育種研究，將對提高我國谷子育種水平起到促進作用。

谷子是最節水的谷類作物，用水量僅為玉米的1/2-2/3，是我國西部干旱地區和貧瘠山區解決糧食問題唯一現實的選擇。在耕地資源不斷減少、水資源日益短缺、平衡膳食熱逐漸升溫、畜牧業不斷發展的形勢下，大力推進谷子產業既能增加糧食產出、促進畜牧業發展，又能推廣節水農業、帶動相關產業發展，一舉多得，社會效益顯著。

谷子是典型的自花授粉作物，谷子的育性與否與谷子的育種關系密切，直接影響到谷子的育種工作。

發明內容

本發明的目的是提供一種與谷子育性基因緊密連鎖的分子標記。

本發明的另一目的是提供一種可用于PCR擴增與谷子育性基因緊密連鎖的分子標記的引物對，以及由該引物對擴增獲得的分子標記。

本發明的再一目的是提供上述分子標記在谷子育性基因定位、檢測以及谷子輔助育種中的用途以及上述分子標記的檢測方法。

本發明的目的還包括提供一種包括上述分子標記的載體，以及含有該載體的重組細胞；提供一種包括使用上述分子標記的谷子育性基因的定位方法，和使用所述分子標記的谷子輔助育種方法。

為了實現上述目的，本發明采用了以下技術方案：

本發明公開了一種與谷子育性基因緊密連鎖的分子標記，所述分子標記含有Seq?ID?No.1所示序列；優選的所述分子標記具有Seq?ID?No.1所示序列。需要指出的是，所述育性基因指谷子自交能夠結實的基因，即含有該基因的谷子樣本植株全穗籽粒均可育，可進行自花授粉。

本發明還公開了一種擴增與谷子育性基因緊密連鎖的分子標記的引物對，所述引物對的引物1含有Seq?ID?No.2所示序列，引物2含有Seq?ID?No.3所示序列；優選的所述引物1具有Seq?ID?No.2所示序列，引物2具有Seq?ID?No.3所示序列；

Seq?ID?No.2：5’-CTAAGTAGACGAGTGATGTG-3’；

Seq?ID?No.3：5’-ACATAAAACCTGTGGCAGTAT-3’。

本發明還公開了一種與谷子育性基因緊密連鎖的分子標記，所述分子標記是由上述的引物對以育性的谷子基因組DNA為模板經PCR擴增得到的。

優選的由上述引物對擴增得到的分子標記含有Seq?ID?No.1所示序列。

在本發明的一個實施方案中，所述分子標記(含有Seq?ID?No.1所示核苷酸序列的DNA片段)為谷子基因組中Seq?ID?No.1所示核苷酸序列的DNA片段，即所包含的Seq?ID?No.1的5’端和/或3’端以外的核苷酸序列也是谷子基因組中的序列，優選的，為谷子基因組中Seq?ID?No.1的5’端和/或3’端的上下游序列。本領域技術人員可以理解，只要擴增或者檢測育性的谷子基因組DNA中的該分子標記，必然能夠檢測或擴增到含有Seq?ID?No.1所示的序列。Seq?ID?No.1的5’端和/或3’端的上下游序列的長度為適當長度，并不特別限定，例如，滿足分子標記的長度小于10,000bp、小于5,000bp、小于2,000bp、小于1,500bp、小于1,200bp、小于1,000bp、或者小于800bp。

在本發明的一個實施方案中，所述分子標記(含有Seq?ID?No.1所示核苷酸序列的DNA片段)所包含的Seq?ID?No.1的5’端和/或3’端可操作地連接有人工序列和/或控制序列，例如啟動子、增強子、終止子、酶切位點、引物序列等等。其中，術語“可操作地”在本發明中定義為一種如下構象，在該構象中，控制序列例如啟動子被適當地置于Seq?ID?No.1的一個位置上，以致該控制序列指導Seq?ID?No.1編碼的多肽的產生。