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[發明專利]用于預測對HCV治療持續應答的生物標志物無效

專利信息
申請號: 201080054518.3 申請日: 2010-11-29
公開(公告)號: CN102656459A 公開(公告)日: 2012-09-05
發明(設計)人: S-H·邱;Y·朱 申請(專利權)人: 弗·哈夫曼-拉羅切有限公司
主分類號: G01N33/576 分類號: G01N33/576
代理公司: 北京市中咨律師事務所 11247 代理人: 史文靜;黃革生
地址: 瑞士*** 國省代碼: 瑞士;CH
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 用于 預測 hcv 治療 持續 應答 生物 標志
【權利要求書】:

1.預測感染丙型肝炎病毒1型基因型(HCV-1)或丙型肝炎病毒4型基因型(HCV-4)的人對象對用干擾素、利巴韋林和HCV?NS5B聚合酶抑制劑的治療將實現持續的病毒學應答(SVR)的方法,其包括:

(i)提供來自在所述治療之前(治療前)所述對象的樣品,

(ii)確定所述樣品中選自CD30、MIG、TARC、TGFβ1、SDF1b,和Eotaxin-2的至少一種蛋白質的表達水平,和

(iii)將所述樣品中的至少一種蛋白質的表達水平與代表源自對所述治療未實現SVR的患者群體的治療前的樣品的至少一種蛋白質的表達水平的參照值對比;

其中,在所述樣品中的至少一種蛋白質的統計學顯著更高的表達水平指示了所述對象將對所述治療實現SVR。

2.權利要求1的方法,其中確定至少兩種蛋白質的表達水平。

3.權利要求1或2的方法,其中確定至少三種蛋白質的表達水平。

4.預測感染丙型肝炎病毒1型基因型(HCV-1)或丙型肝炎病毒4型基因型(HCV-4)的人對象對用干擾素、利巴韋林和HCV?NS5B聚合酶抑制劑的治療將實現持續的病毒學應答(SVR)的方法,其包括:

(i)提供來自所述治療一周后(治療后一周)的所述對象的樣品,

(ii)確定所述樣品中選自CD30、TRAIL,和TARC的至少一種蛋白質的表達水平,和

(iii)將所述樣品中的至少一種蛋白質的表達水平與代表源自對所述治療未實現SVR的患者群體中治療后一周的樣品的至少一種蛋白質的表達水平的參照值對比;

其中,在所述樣品中的至少一種蛋白質的統計學顯著更高的表達水平指示了所述對象將對所述治療實現SVR。

5.權利要求4的方法,其中確定至少兩種蛋白質的表達水平。

6.權利要求4或5的方法,其中確定至少三種蛋白質的表達水平。

7.預測感染丙型肝炎病毒I型基因型(HCV-1)或丙型肝炎病毒4型基因型(HCV-4)的人對象對用干擾素、利巴韋林和HCV?NS5B聚合酶抑制劑的治療將實現持續的病毒學應答(SVR)的方法,其包括:

(i)提供來自在所述治療之前(治療前)的所述對象的樣品,

(ii)確定所述樣品中選自HCC4、MIP1b、SDF1b、TNFRII、ITAC、MIG、IL2R,和IL16的至少一種蛋白質的表達水平,和

(iii)提供來自所述治療一周后(治療后一周)的所述對象的樣品,

(iv)確定所述樣品中選自HCC-4、MIP1b、SDF1b、TNFRII、ITAC、MIG、IL2R,和IL16的至少一種蛋白質的表達水平,

(v)確定來自所述對象的治療前的樣品和來自所述對象的治療后一周的樣品之間至少一種蛋白質的差異表達水平,和

(vi)將至少一種蛋白質的所述差異表達水平與代表下述至少一種蛋白質的差異表達水平的參照值對比,所述蛋白質源自對所述治療未實現SVR的患者群體中的治療前的樣品和治療后一周的樣品;

其中,至少一種蛋白質差異表達水平的統計學顯著改變指示了所述對象將對所述治療實現SVR。

8.權利要求7的方法,其中確定至少兩種蛋白質的差異表達水平。

9.權利要求7或8的方法,其中確定至少三種蛋白質的差異表達水平。

10.預測感染丙型肝炎病毒基因型1(HCV-1)或丙型肝炎病毒基因型4(HCV-4)的人對象對用干擾素、利巴韋林和HCV?NS5B聚合酶抑制劑的治療將實現持續的病毒學應答(SVR)的方法,其包括:

(i)提供來自所述治療之前(治療前)的所述對象的樣品,

(ii)以皮克每毫升,確定所述樣品中的IP10、CD30、TGFβ1和MIG的表達水平,并使用方程:SVR分數=-47.4-1.1xlog2IP10+3.1xlog2CD30+1.4xlog2TGFβ1+0.5xlog2MIG;

其中SVR分數大于或等于0.5指示了對象將對所述治療實現SVR,而其中SVR分數小于0.5指示了對象將對所述治療不實現SVR。

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