[發明專利]前列腺癌中的復發性基因融合物

無效

• 申請號: 201080051968.7
• 申請日: 2010-09-15
• 公開（公告）號: CN102712953A
• 公開（公告）日: 2012-10-03
• 發明（設計）人: A.M.欽奈延;王曉松
• 申請（專利權）人: 密歇根大學董事會
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/12
• 代理公司: 北京市柳沈律師事務所 11105
• 代理人: 張文輝

1.一種用于鑒定患者的前列腺癌的方法，包括：

(a)提供來自所述患者的樣品；和

(b)檢測具有來自SLC45A3基因的轉錄調控區的5’部分和來自RAF家族基因的3’部分的基因融合物在所述樣品中的存在或不存在，

其中在所述樣品中檢測到基因融合物的存在鑒定了所述患者的前列腺癌。

2.權利要求1所述的方法，其中所述SLC45A3基因的轉錄調控區包含SLC45A3基因的啟動子區域。

3.權利要求1所述的方法，其中步驟(b)包括檢測具有來自SLC45A3基因的轉錄調控區的5’DNA部分和來自RAF家族基因的3’DNA部分的基因組DNA的染色體重排。

4.權利要求1所述的方法，其中步驟(b)包括檢測具有從SLC45A3基因的轉錄調控區轉錄的5’RNA部分和從RAF家族基因轉錄的3’RNA部分的嵌合mRNA轉錄物。

5.權利要求1所述的方法，其中所述樣品選自組織、血液、血漿、血清、尿、尿上清液、尿細胞沉淀、精液、前列腺分泌物或前列腺細胞。

6.權利要求1所述的方法，其中所述RAF家族成員基因選自BRAF和RAF1。

7.一種用于鑒定患者的前列腺癌的方法，包括：

(a)提供來自所述患者的樣品；和

(b)檢測具有來自UBE2L3基因的轉錄調控區的5’部分和來自RAS家族基因的3’部分的基因融合物在所述樣品中的存在或不存在，

其中在所述樣品中檢測到所述基因融合物的存在鑒定了所述患者的前列腺癌。

8.權利要求7所述的方法，其中所述UBE2L3基因的轉錄調控區包含UBE2L3基因的啟動子區域。

9.權利要求7所述的方法，其中步驟(b)包括檢測具有來自UBE2L3基因的轉錄調控區的5’DNA部分和來自RAS家族基因的3’DNA部分的基因組DNA的染色體重排。

10.權利要求7所述的方法，其中步驟(b)包括檢測具有從UBE2L3基因的轉錄調控區轉錄的5’RNA部分和從RAS家族基因轉錄的3’RNA部分的嵌合mRNA轉錄物。

11.權利要求7所述的方法，其中所述樣品選自組織、血液、血漿、血清、尿、尿上清液、尿細胞沉淀、精液、前列腺分泌物或前列腺細胞。

12.權利要求7所述的方法，其中所述RAS家族成員基因為KRAS。

13.一種組合物，其包含如下的至少一種：

(a)包含與嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的接頭雜交的序列的寡核苷酸探針，其中所述嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的5’部分來自SLC45A3基因的轉錄調控區并且所述嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的3’部分來自RAF家族成員基因；

(b)包含與來自SLC45A3基因的轉錄調控區的嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的5’部分雜交的序列的第一寡核苷酸探針，和包含與來自RAF家族成員基因的所述嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的3’部分雜交的序列的第二寡核苷酸探針；

(c)包含與來自SLC45A3基因的調控區的嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的5’部分雜交的序列的第一擴增寡核苷酸，和包含與來自RAF家族成員基因的所述嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的3’部分雜交的序列的第二擴增寡核苷酸；

(d)包含與嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的接頭雜交的序列的寡核苷酸探針，其中所述嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的5’部分來自UBE2L3基因的轉錄調控區并且所述嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的3’部分來自RAS家族成員基因；

(e)包含與來自UBE2L3基因的轉錄調控區的嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的5’部分雜交的序列的第一寡核苷酸探針，和包含與來自RAS家族成員基因的所述嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的3’部分雜交的序列的第二寡核苷酸探針；

(f)包含與來自UBE2L3基因的轉錄調控區的嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的5’部分雜交的序列的第一擴增寡核苷酸，和包含與來自RAS家族成員基因的所述嵌合基因組DNA或嵌合mRNA的3’部分雜交的序列的第二擴增寡核苷酸；和

(g)針對具有由UBE2L3基因編碼的氨基末端部分和由RAS家族成員基因編碼的羧基末端部分的嵌合蛋白的抗體。