[發(fā)明專利]一種基于高通量測(cè)序的DNA標(biāo)簽文庫(kù)構(gòu)建方法

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201010299271.3
• 申請(qǐng)日: 2010-09-21
• 公開（公告）號(hào): CN102409048A
• 公開（公告）日: 2012-04-11
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 章文蔚;張艷艷;于競(jìng);田方;陳海燕;龔梅花;周妍
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 深圳華大基因科技有限公司;深圳華大基因研究院
• 主分類號(hào): C12N15/11
• 分類號(hào): C12N15/11;C40B40/06;C40B50/06
• 代理公司: 中國(guó)國(guó)際貿(mào)易促進(jìn)委員會(huì)專利商標(biāo)事務(wù)所 11038
• 代理人: 羅菊華

1.一組DNA標(biāo)簽，所述DNA標(biāo)簽包括如下或由如下組成：表2所示DNA標(biāo)簽或與之相差1個(gè)堿基的DNA標(biāo)簽中的至少5個(gè)，或至少10個(gè)，或至少15個(gè)，或至少20個(gè)，至少25個(gè)，或至少30個(gè)，或至少35個(gè)，或至少40個(gè)，或45個(gè)，或至少50個(gè)，或至少55個(gè)，或全部59個(gè)，

所述DNA標(biāo)簽優(yōu)選地至少包括表2所示的59個(gè)DNA標(biāo)簽的DNAIndex1～DNA?Index5，或DNA?Index6～DNA?Index10，或DNAIndex11～DNA?Index15，或DNA?Index16～DNA?Index20，或DNAIndex21～DNA?Index25，或DNA?Index26～DNA?Index30，或DNAIndex31～DNA?Index35，或DNA?Index36～DNA?Index40，或DNAIndex41～DNA?Index45，或DNA?Index46～DNA?Index50，或DNAIndex51～DNA?Index55，或DNA?Index55～DNA?Index59，或者他們?nèi)魏蝺蓚€(gè)或多個(gè)的組合。

2.權(quán)利要求1所述的DNA標(biāo)簽，其中所述的相差1個(gè)堿基包括標(biāo)簽中1個(gè)堿基的取代、添加或刪除。

3.權(quán)利要求1或2所述的DNA標(biāo)簽用于構(gòu)建DNA標(biāo)簽文庫(kù)的用途，其中DNA標(biāo)簽文庫(kù)的DNA標(biāo)簽接頭在3’末端包含所述DNA標(biāo)簽，從而構(gòu)成各自相對(duì)應(yīng)的DNA標(biāo)簽接頭，所述DNA標(biāo)簽接頭優(yōu)選地用作DNA標(biāo)簽文庫(kù)的接頭。

4.權(quán)利要求3所述的用途，其中所述DNA標(biāo)簽插入DNA標(biāo)簽接頭中的3’末端中，或通過(guò)或不通過(guò)連接子連接在DNA接頭的3’末端，優(yōu)選地插入DNA標(biāo)簽接頭中的3’末端中；更優(yōu)選地距離DNA標(biāo)簽接頭中的3’末端1個(gè)堿基插入DNA標(biāo)簽接頭中。

5.通過(guò)權(quán)利要求1或2所述的DNA標(biāo)簽構(gòu)建的DNA標(biāo)簽文庫(kù)。

6.含有權(quán)利要求1或2所述的DNA標(biāo)簽的一組DNA標(biāo)簽接頭，其中DNA標(biāo)簽文庫(kù)的DNA標(biāo)簽接頭在3’末端包含權(quán)利要求1所述的標(biāo)簽，并且優(yōu)選地用作接頭，所述一組所述DNA標(biāo)簽接頭包括如下或由如下組成：表3所示59個(gè)DNA標(biāo)簽接頭或與其所包含的DNA標(biāo)簽序列相差1個(gè)堿基的DNA標(biāo)簽接頭中的至少5個(gè)，或至少10個(gè)，或至少15個(gè)，或至少20個(gè)，至少25個(gè)，或至少30個(gè)，或至少35個(gè)，或至少40個(gè)，或45個(gè)，或至少50個(gè)，或至少55個(gè)，或全部59個(gè)，

所述DNA標(biāo)簽接頭優(yōu)選地至少包括表3所示的59個(gè)DNA標(biāo)簽接頭中的DNA?Index1F/R_adapter～DNA?Index5F/R_adapter，或DNAIndex6F/R_adapter～DNA???Index10F/R_adapter，或DNAIndex11F/R_adapter～DNA??Index15F/R_adapter，或DNAIndex16F/R_adapter～DNA??Index20F/R_adapter，或DNAIndex21F/R_adapter～DNA??Index25F/R_adapter，或DNAIndex26F/R_adapter～DNA??Index30F/R_adapter，或DNAIndex31F/R_adapter～DNA??Index35F/R_adapter??，或DNAIndex36F/R_adapter～DNA??Index40F/R_adapter，或DNAIndex41F/R_adapter～DNA??Index45F/R_adapter，或DNAIndex46F/R_adapter～DNA??Index50F/R_adapter，或DNAIndex51F/R_adapter～DNA??Index55F/R_adapter，或DNAIndex55F/R_adapter～DNA??Index59F/R_adapter，或者他們?nèi)魏蝺蓚€(gè)或多個(gè)的組合。

7.權(quán)利要求6所述的DNA標(biāo)簽接頭，其中所述的相差1個(gè)堿基包括標(biāo)簽中1個(gè)堿基的取代、添加或刪除。

8.權(quán)利要求6或7所述的DNA標(biāo)簽接頭用于構(gòu)建DNA標(biāo)簽文庫(kù)的用途，優(yōu)選地所述DNA標(biāo)簽接頭用作DNA標(biāo)簽文庫(kù)的接頭。

9.通過(guò)權(quán)利要求6或7所述的DNA標(biāo)簽接頭構(gòu)建的DNA標(biāo)簽文庫(kù)。