[發明專利]一種用于陸地棉抗黃萎病性狀輔助選擇育種的分子標記

有效

• 申請號: 201010294455.0
• 申請日: 2010-09-28
• 公開（公告）號: CN102080080A
• 公開（公告）日: 2011-06-01
• 發明（設計）人: 王紅梅;趙云雷;陳偉;李運海;龔海燕;桑曉慧
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院棉花研究所
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 北京一格知識產權代理事務所 11316
• 代理人: 滑春生

1.一種用于陸地棉抗黃萎病性狀輔助選擇育種的分子標記，其特征在于，按照下列步驟獲得：

1)利用抗黃萎病陸地棉品種“常抗棉”和感黃萎病陸地棉標準系“TM-1”雜交的F2分離群體，對抗黃萎病性狀進行分子標記定位。

2)依據SSR標記，對田間育種群體進行分組。

3)分析每組的相對病指與標記基因型的有效性符合情況。

4)標記基因型組間的相對病指差異顯著或極顯著的標記，被確定為陸地棉抗黃萎病輔助選擇育種的SSR分子標記。

2.根據權利要求1所述的對抗黃萎病性狀進行標記定位，其特征在于：用SSR、RAPD和SRAP三種標記構建遺傳連鎖圖，再用F2∶3家系對抗黃萎病性狀進行標記定位。

3.根據權利要求1所述的依據SSR標記，對田間育種群體進行分組，其特征在于：依據表現顯著性的SSR標記和復合區間作圖中與抗性QTL緊密連鎖的SSR標記的基因型，對群體進行+-標記記錄分組。

4.根據權利要求1所述的分析每組的相對病指與標記基因型的有效性符合情況，其特征在于：計算每組的平均相對病指，每組的相對病指數值大小按無標記純合基因型(--)、雜合基因型(+-)、有標記純合基因型(++)的排列順序依次遞減，則確定該標記在輔助選擇上具有有效性。

5.根據權利要求1所述的標記基因型組間的相對病指差異顯著或極顯著的標記，其特征在于：對初步確定的有效性標記，對其每組的平均相對病指數值進行差異顯著性分析，達到顯著或極顯著水平差異的標記。

6.根據權利要求1所述的被確定為陸地棉抗黃萎病輔助選擇育種的SSR分子標記，其特征在于：SSR標記有三個，標記名稱分別為BNL1721、BNL2733、BNL3452。

7.根據權利要求6所述的三個SSR標記，其特征在于：每個SSR標記相應地需用三對上、下游引物進行擴增。

8.根據權利要求7所述的SSR標記相應地上、下游引物，其特征在于：標記BNL1721的上游引物(5′-3′)為TGTCGGAATCTTAAGACCGG、下游引物(5′-3′)為GCGCAGATCCTCTTACCAAA，標記BNL2733的上游引物(5′-3′)為TCGAGGGTTTAGGGTTCCTG、下游引物(5′-3′)為AATTGTGCAACACCTCCCTC，標記BNL3452的上游引物(5′-3′)為TGTAACTGAGCAGCCGTACG、下游引物(5′-3′)為GCCAAAGCAGAGTGAGATCC。