[發明專利]一種密碼子偏愛優化的二羥基聯苯雙加氧酶基因RRBPHCI降解多氯聯苯的的生物學方法

無效

• 申請號: 201010252204.6
• 申請日: 2010-08-12
• 公開（公告）號: CN102373228A
• 公開（公告）日: 2012-03-14
• 發明（設計）人: 熊愛生;姚泉洪;彭日荷;帥建軍;田永生;趙偉;付曉燕;金曉芬;朱波;許晶;韓紅娟;陳晨
• 申請（專利權）人: 上海市農業科學院
• 主分類號: C12N15/53
• 分類號: C12N15/53;C12N15/78;C12N1/21;A62D3/02;C12R1/39;A62D101/22
• 代理公司: 上海開祺知識產權代理有限公司 31114
• 代理人: 費開逵

技術領域

本發明屬微生物基因工程領域，具體涉及一種密碼子偏愛優化的二羥基聯苯雙加氧酶基因降解多氯聯苯的生物學方法。

背景技術

多氯聯苯是一種結構穩定、毒性大和水溶性低的芳香族化合物，具有致癌、致突變和生殖發育毒性，是《斯德哥爾摩公約》中禁止使用的12種有機污染物之一。生物修復多氯聯苯(Polychlorinated?biphenyls，PCBs)作為一種很有潛力的修復方法優勢明顯。綜合考慮各種因素的生物修復系統也是將來的一個研究方向。微生物降解PCBs主要分為兩個方向，即好氧菌的氧化作用和厭氧菌的還原脫氯作用【Furukawa，J?Gen?Appl?Microbiol，2000，46：283-296】。近年來，許多研究都集中在分離降解PCBs的菌株上，分析降解PCBs的機理，分離相關基因，然后進一步改造基因構建新的降解工程菌株。

PCBs的降解是一系列聯苯降解酶控制輔助代謝的過程【Abramowicz，Cri?Rev?Biotech，1990，10：241-251；Furukawa，Biodegradation，1994，5：289-300】。這些酶主要分為四類，包括聯苯雙加氧酶(BphA)，二氫二羥基脫氫酶(BphB)，2，3二羥基雙加氧酶(BphC)和水解酶(BphD)【Furukawa和Fuiihara，J?Biosci?Bioeng，2008，105：433-449】。這一系列酶是由bph的基因簇編碼的，根據基因的結構該家族可以分為四類【Hong等，Int?BiodeterBiodegr，2009，63：365-370】。第一類bph基因簇是在Burkholderia?sp.LB400【Erickson和Mondello，J?Bact，1992，174：2903-2312；Hofer等，Gene，1994，144：9-16】和Pseudomonas?pseudoalcaligenes?KF707【Furukawa和Miyazaki，Bacteriol，1986，166：392-398】中間發現的，包含bphRA1A2A3A4BCKHJID基因；第二類基因簇(bphSEGFA1A2A3BCDA4)是在Achromobactergeorgiopolitanum?strain?KKS102【Kimbara等，J?Bact，1989，171：2740-2747；Kikuchi等，J?Bact，1994，176：4269-4276】和Alcaligenes?eutrophus?A5【Springael等，J?Bact，1993，175：1674-1681；Mouz等，Mol?gen?genet，1999，262：790-799】中發現的；第三類由bphA1A2A3A4CBST組成的基因簇是在Rhodococcus?sp.strain?RHA1【Masai等，Appl?Environ?Micro，1995，61：2079-2085】發現的；最近一種新的bph基因簇(bphBCA1A2A3A4D)在Rhodococcus?sp.strain?R04【Yang等，J?Appl?Micro，2007，103：2214-2224】和Rhodococcus?sp.strain?K37【Taguchi等，Biosci?Biotechnol?Biochem，2007，71：1136-1144】中被發現，而且與過去報道的基因簇不同，故歸類為第四種bph家族。