[發(fā)明專利]黃脂菌素的生物合成基因簇

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201010251262.7
• 申請日: 2010-08-11
• 公開（公告）號: CN102010871A
• 公開（公告）日: 2011-04-13
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 由德林;張維克;鄧子新;褚以文;王輅;趙子翰
• 申請（專利權(quán)）人: 上海交通大學(xué);中國醫(yī)藥集團總公司四川抗菌素工業(yè)研究所
• 主分類號: C12N15/31
• 分類號: C12N15/31;C12N15/52;C12N15/53;C12N15/54;C12N15/55;C12N15/60
• 代理公司: 上海交達專利事務(wù)所 31201
• 代理人: 王錫麟;王桂忠

1.一種黃脂菌素的生物合成基因簇，其特征在于，包括49個基因的核苷酸序列或由序列1形成的互補序列，其中：負(fù)責(zé)合成碳骨架及對其進行后修飾共二十九個基因：xanO1、xanO2、xanO3、xanO4、xanO5、xanO6、xanO7、xanO8、xanO9、xanO10、xanM1、xanM2、xanM3、xanZ1、xanZ2、xanZ3、xanZ4、xanS1、xanS2、xanG、xanA、xanH、xanK、xanD、xanE、xanF、xanC1、xanC2、xanC3；負(fù)責(zé)提供碳骨架延伸單位及后修飾過程中的甲基供體共八個基因：xanB1、xanB2、xanB3、xanY1、xanY2、xanY3、xanY4、xanY5；負(fù)責(zé)對xantholipin的生物合成進行調(diào)控共三個基因：xanR1、xanR2、xanR3；負(fù)責(zé)為宿主菌提供抗性共三個基因：xanU、xanN、xanQ；在此生物合成過程中還有六個基因：xanJ、xanP、xanL、xanW、xanT、xanV。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的黃脂菌素的生物合成基因簇，其特征是，所述的序列1，一個編碼腺苷高半胱氨酸水解酶的核苷酸序列由序列2中的氨基酸序列組成，命名為xanY1，其基因核苷酸序列位于序列1中第1419-1堿基處；

一個編碼5，10-亞甲基四氫葉酸還原酶的核苷酸序列由序列3中的氨基酸序列組成，命名為xanY2，其基因核苷酸序列位于序列1中第2299-1397堿基處；

一個編碼甲硫氨酸合成酶的核苷酸序列由序列4中的氨基酸序列組成，命名為xanY3，其基因核苷酸序列位于序列1中第5802-2305堿基處；

一個編碼糖激酶的核苷酸序列由序列5中的氨基酸序列組成，命名為xanY4，其基因核苷酸序列位于序列1中第6791-5799堿基處。

一個編碼S-甲硫腺苷合酶的核苷酸序列由序列6中的氨基酸序列組成，命名為xanY5，其基因核苷酸序列位于序列1中第8037-6817堿基處；

一個編碼單加氧酶的核苷酸序列由序列7中的氨基酸序列組成，命名為xanO1，其基因核苷酸序列位于序列1中第8583-8146堿基處；

一個編碼脫氫酶的核苷酸序列由序列8中的氨基酸序列組成，命名為xanS1，其基因核苷酸序列位于序列1中第9803-8580堿基處；

一個編碼功能未知蛋白的核苷酸序列由序列9中的氨基酸序列組成，命名為xanJ，其基因核苷酸序列位于序列1中第9867-10595堿基處；

一個編碼孢子外衣蛋白的核苷酸序列由序列10中的氨基酸序列組成，命名為xanP，其基因核苷酸序列位于序列1中第10592-12211堿基處；

一個編碼糖基轉(zhuǎn)移酶的核苷酸序列由序列11中的氨基酸序列組成，命名為xanG，其基因核苷酸序列位于序列1中第12379-13554堿基處；

一個編碼天冬酰氨合酶的核苷酸序列由序列12中的氨基酸序列組成，命名為xanA，其基因核苷酸序列位于序列1中第13542-15386堿基處；

一個編碼轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子的核苷酸序列由序列13中的氨基酸序列組成，命名為xanR1，其基因核苷酸序列位于序列1中第15392-16075堿基處；

一個編碼細(xì)胞色素P450羥化酶的核苷酸序列由序列14中的氨基酸序列組成，命名為xanO2，其基因核苷酸序列位于序列1中第16114-17316堿基處；

一個編碼3Fe-S還原蛋白的核苷酸序列由序列15中的氨基酸序列組成，命名為xanK，其基因核苷酸序列位于序列1中第17333-17602堿基處；

一個編碼抗性轉(zhuǎn)運蛋白的核苷酸序列由序列16中的氨基酸序列組成，命名為xanU，其基因核苷酸序列位于序列1中第17599-19728堿基處；

一個編碼黃素單加氧酶的核苷酸序列由序列17中的氨基酸序列組成，命名為xanO3，其基因核苷酸序列位于序列1中第19908-21086堿基處；

一個編碼乳酸酰谷胱苷肽裂解酶的核苷酸序列由序列18中的氨基酸序列組成，命名為xanL，其基因核苷酸序列位于序列1中第21707-21147堿基處；

一個編碼非血紅素鹵化酶的核苷酸序列由序列19中的氨基酸序列組成，命名為xanH，其基因核苷酸序列位于序列1中第22057-23472堿基處；

一個編碼肽鏈轉(zhuǎn)移蛋白的核苷酸序列由序列20中的氨基酸序列組成，命名為xanQ，其基因核苷酸序列位于序列1中第23469-25070堿基處；

一個編碼氧甲基轉(zhuǎn)移酶的核苷酸序列由序列21中的氨基酸序列組成，命名為xanM1，其基因核苷酸序列位于序列1中第25067-26086堿基處；

一個編碼還原酶的核苷酸序列由序列22中的氨基酸序列組成，命名為xanZ1，其基因核苷酸序列位于序列1中第26651-27508堿基處；

一個編碼膜離子反向運輸?shù)鞍椎暮塑账嵝蛄杏尚蛄?3中的氨基酸序列組成，命名為xanN，其基因核苷酸序列位于序列1中第28888-27593堿基處；

一個編碼功能未知蛋白的核苷酸序列由序列24中的氨基酸序列組成，命名為xanW，其基因核苷酸序列位于序列1中第29473-28985堿基處；

一個編碼轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白的核苷酸序列由序列25中的氨基酸序列組成，命名為xanR2，其基因核苷酸序列位于序列1中第29600-30061堿基處；

一個編碼氧甲基轉(zhuǎn)移酶的核苷酸序列由序列26中的氨基酸序列組成，命名為xanM2，其基因核苷酸序列位于序列1中第31105-30083堿基處；

一個編碼黃素單加氧酶的核苷酸序列由序列27中的氨基酸序列組成，命名為xanO4，其基因核苷酸序列位于序列1中第32742-31120堿基處；

一個編碼甲基轉(zhuǎn)移酶的核苷酸序列由序列28中的氨基酸序列組成，命名為xanM3，其基因核苷酸序列位于序列1中第33084-34118堿基處；

一個編碼黃素單加氧酶的核苷酸序列由序列29中的氨基酸序列組成，命名為xanO5，其基因核苷酸序列位于序列1中第34203-35798堿基處；

一個編碼還原酶的核苷酸序列由序列30中的氨基酸序列組成，命名為xanS2，其基因核苷酸序列位于序列1中第35868-36554堿基處；

一個編碼氧化還原酶的核苷酸序列由序列31中的氨基酸序列組成，命名為xanZ2，其基因核苷酸序列位于序列1中第37667-36759堿基處；

一個編碼轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白的核苷酸序列由序列32中的氨基酸序列組成，命名為xanR3，其基因核苷酸序列位于序列1中第37715-38722堿基處；

一個編碼生物素羧化酶的核苷酸序列由序列33中的氨基酸序列組成，命名為xanB1，其基因核苷酸序列位于序列1中第40187-38844堿基處；

一個編碼生物素羧基載體蛋白的核苷酸序列由序列34中的氨基酸序列組成，命名為xanB2，其基因核苷酸序列位于序列1中第40714-40190堿基處；

一個編碼羧基轉(zhuǎn)移酶的核苷酸序列由序列35中的氨基酸序列組成，命名為xanB3，其基因核苷酸序列位于序列1中第42468-40774堿基處；

一個編碼單加氧酶的核苷酸序列由序列36中的氨基酸序列組成，命名為xanO6，其基因核苷酸序列位于序列1中第42857-42546堿基處；

一個編碼單加氧酶的核苷酸序列由序列37中的氨基酸序列組成，命名為xanO7，其基因核苷酸序列位于序列1中第43194-42847堿基處；

一個編碼3-氧酰-酰基載體蛋白還原酶的核苷酸序列由序列38中的氨基酸序列組成，命名為xanZ3，其基因核苷酸序列位于序列1中第43946-43194堿基處；

一個編碼單加氧酶的核苷酸序列由序列39中的氨基酸序列組成，命名為xanO8，其基因核苷酸序列位于序列1中第44431-43970堿基處；

一個編碼環(huán)化酶的核苷酸序列由序列40中的氨基酸序列組成，命名為xanC1，其基因核苷酸序列位于序列1中第44909-44442堿基處；

一個編碼β-酮酰合酶β的核苷酸序列由序列41中的氨基酸序列組成，命名為xanE，其基因核苷酸序列位于序列1中第46303-45017堿基處；

一個編碼β-酮酰合酶α的核苷酸序列由序列42中的氨基酸序列組成，命名為xanF，其基因核苷酸序列位于序列1中第47583-46306堿基處；

一個編碼環(huán)化酶的核苷酸序列由序列43中的氨基酸序列組成，命名為xanC2，其基因核苷酸序列位于序列1中第48014-47580堿基處；

一個編碼CurD同源蛋白的核苷酸序列由序列44中的氨基酸序列組成，命名為xanT，其基因核苷酸序列位于序列1中第48198-48584堿基處；

一個編碼氧化酶類似蛋白的核苷酸序列由序列45中的氨基酸序列組成，命名為xanO9，其基因核苷酸序列位于序列1中第48596-50014堿基處；

一個編碼單加氧酶的核苷酸序列由序列46中的氨基酸序列組成，命名為xanO10，其基因核苷酸序列位于序列1中第50513-50067堿基處；

一個編碼功能未知蛋白的核苷酸序列由序列47中的氨基酸序列組成，命名為xanV，其基因核苷酸序列位于序列1中第50908-50528堿基處；

一個編碼3-氧酰-酰基載體蛋白還原酶的核苷酸序列由序列48中的氨基酸序列組成，命名為xanZ4，其基因核苷酸序列位于序列1中第51663-50908堿基處；

一個編碼酰基載體蛋白的核苷酸序列由序列49中的氨基酸序列組成，命名為xanD，其基因核苷酸序列位于序列1中第51920-51660堿基處；

一個編碼環(huán)化酶的核苷酸序列由序列50中的氨基酸序列組成，命名為xanC3，其基因核苷酸序列位于序列1中第52255-51917堿基處。