[發明專利]一種紅細胞吸附法聯合RT-PCR檢測具有血凝性病毒的方法無效
| 申請號: | 201010154786.4 | 申請日: | 2010-04-23 |
| 公開(公告)號: | CN102234692A | 公開(公告)日: | 2011-11-09 |
| 發明(設計)人: | 易建中;劉成倩 | 申請(專利權)人: | 上海市農業科學院 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海開祺知識產權代理有限公司 31114 | 代理人: | 費開逵 |
| 地址: | 201106*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 紅細胞 吸附 聯合 rt pcr 檢測 具有 血凝 性病 方法 | ||
技術領域
本發明涉及一種紅細胞吸附法聯合RT-PCR檢測具有血凝性病毒的方法,具體涉及一種以新城疫為研究對象,采用紅細胞吸附法聯合RT-PCT檢測具有血凝性病毒的方法。
背景技術
有些病毒能吸附于雞、火雞和鴨等動物的紅細胞表面,并引起紅細胞凝集,這種特性與病毒囊膜上的纖突所含血凝素和神經氨酸酶有關。具有這種特性的病毒主要有新城疫和禽流感等。
新城疫(Newcastle?Disease,ND)是由新城疫病毒(Newcastle?disease?virus,NDV)引起的一種極易傳染的毀滅性疾病,典型癥狀是呼吸道、消化道黏膜出血,最常侵襲家雞,也能感染許多其它家禽和野鳥,人也有易感性。該病1926年首次發現于印尼,同年發現于英國新城,因此得名新城疫。該病分布于世界各地,1928年我國已有該病的記載,1935年在我國有些地區流行。新城疫感染的死亡率高達100%,同高致病性禽流感同屬A類病,給世界養禽業帶來巨大的威脅。目前用于檢測NDV的方法有血凝和血凝抑制試驗、酶聯免疫吸附試驗、病毒分離法等,這些方法雖然可以對病原作出診斷,但卻存在費時、代價高、敏感性和穩定性不夠好的缺點。
發明內容
本發明所要解決的技術問題在于提供一種紅細胞吸附法聯合RT-PCR檢測具有血凝性病毒的方法。以新城疫病毒(NDV)作為研究對象,選取NDV的核衣殼蛋白的核苷酸序列設計一對引物,利用其能吸附于雞、火雞和鴨等動物的紅細胞表面這一重要生物學特性,建立一種適合于NDV快速檢測的紅細胞吸附聯合RT-PCR法。本發明方法敏感性和穩定性都很好,具有較大的臨床運用價值,也同樣適合于禽流感等具有血凝性病毒的檢測。
本發明的紅細胞吸附法聯合RT-PCR檢測具有血凝性病毒的方法,具體包括以下步驟:
1)制備紅細胞
用滅菌注射器吸取檸檬酸抗凝劑1mL(其用量為所需血量的1/4體積),從雞翅靜脈抽血4mL,置滅菌離心管內,加滅菌PBS10mL,以2000r/min離心5min,棄上清液,再加滅菌PBS?10mL懸浮血球,再以2000r/min離心5min,如此將紅細胞洗滌三次即可。
2)紅細胞吸附NDV
取出從雞場采集的污染糞便0.1g,加2mLPBS振蕩混勻,使病毒溶解于PBS中,以10000r/min離心5min,取離心后上清液加約50uL的紅細胞,室溫作用1小時,2000r/min離心5min,棄上清,沉淀即為含有NDV的紅細胞。如果污染的病料中含極少NDV,可通過紅血球多次吸附以集中NDV。
3)病毒RNA提取
RNA提取按Trizol-A+提取總RNA說明書進行。
4)RT-PCR擴增
i)引物設計與合成
根據GenBank上已公布的NDV-NP基因序列,設計合成了一對特異性引物,能擴增578bp的基因片段。引物序列如下:
NP-F1:5′TATTCTGTCTTCGGATTGCT?3′
NP-R1:5′GCTCCCACCTGCTGTATT?3′
以上引物均由上海捷瑞生物工程有限公司合成。
ii)反轉錄
冰上操作,在PCR管中依次加入焦碳酸二乙酯(DEPC)處理水6μL,5×反轉錄酶Buffer?4μL,dNTP?Mixture(10mM)1μL,NP上游引物F11μL(10μM),RNA酶抑制劑1μL,NDV病毒RNA?5μL,AMV反轉錄酶2μL(5U/μL),總體積20μL。在冰上混合后,室溫放置10min,42℃1h后冰上冷卻2~3min;所得的反應液可立刻用于PCR反應或-20℃保存備用。
iii)PCR反應
在PCR管中依次加入反轉錄產物2μL,10×Buffer(Mg2+free)2.5μL,MgSO42μL,dNTP(10mM)1μL,NP-F1、NP-R1(10μM)各1μL,Taq?DNA聚合酶(5U/μL)0.25μL,ddH2O?15.25μL;總體積25μL在冰上混合。
PCR反應條件:94℃預變性5min,94℃變性30s,49℃退火25s,72℃延伸60s,循環32次,最后72℃延伸10min。
5)敏感性試驗
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