[發明專利]小鼠巨細胞病毒實時熒光定量PCR檢測方法無效
| 申請號: | 201010110266.3 | 申請日: | 2010-02-03 |
| 公開(公告)號: | CN101935712A | 公開(公告)日: | 2011-01-05 |
| 發明(設計)人: | 陳林鳳;潘振華;張紅;盛青松 | 申請(專利權)人: | 無錫奧瑞生物醫藥科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64;C12R1/93 |
| 代理公司: | 無錫市大為專利商標事務所 32104 | 代理人: | 曹祖良 |
| 地址: | 214091 江蘇省無錫市濱湖區*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 小鼠 巨細 病毒 實時 熒光 定量 pcr 檢測 方法 | ||
1.小鼠巨細胞病毒實時熒光定量PCR檢測方法,包括有標準質粒的構建、特異性引物及熒光探針的設計、實時熒光定量PCR擴增及建立檢測標準曲線、感染病毒樣本的RNA提取及DNA的制備、有效性驗證及結果檢測判定,其特征在于,所述特異性引物包含有正向引物(PrimerF)、反向引物(PrimerR),其中:
正向引物的序列為:5’-AGCGTCGATGCAGGGGCTTT-3’,
反向引物的序列為:5’-CGGCGGAACGGGGGCTGGTA-3’;
所述熒光探針的序列為:5’-CGGGGGCGTTCCGAAAACGA-3’。
2.如權利要求1所述的小鼠巨細胞病毒實時熒光定量PCR檢測方法,其特征還在于,所述實時熒光定量PCR擴增及建立檢測標準曲線的步驟為:
(1)模板的制備:
將構建的標準質粒作10倍系列稀釋,以稀釋液為模板;具體如下:定量標準質粒為3.01×109拷貝/μl,用稀釋液將標準質粒按10倍稀釋,即稀釋成濃度分別為1.0×108、1.0×107、1.0×106、1.0×105、1.0×104的稀釋液,稀釋液在-20℃條件下保存備用;
(2)實時熒光定量PCR反應體系:
25μl的PCR反應體系含有成分如下:DEPC水,15.75μl;10×PCRbuffer,2.5μl;10mM?dNTPs,0.5μl;1.25U?Tag?DNA聚合酶,0.25μl;300nM正向引物(PrimerF),2.5μl;300nM反向引物(PrimerR),2.5μl;模板,1μl;
(3)循環反應:
根據步驟(2)中的PCR反應體系加樣,將加好樣的PCR試劑管放入熒光PCR儀中,設置相應的熒光采集條件后進行擴增,反應循環程序為:(a)、95℃預變性5min,1個循環;(b)、95℃變性20sec,55℃退火30sec,72℃延伸30sec,40個循環后反應結束,得到反應產物;
(4)建立檢測標準曲線:熒光PCR儀采集熒光信號,經計算機軟件自動生成以起始模板數對數為x軸,CT值為y軸的標準曲線。
3.如權利要求1所述的小鼠巨細胞病毒實時熒光定量PCR檢測方法,其特征還在于,所述有效性驗證及結果檢測判定的步驟為:
(1)利用未感染小鼠巨細胞病毒小鼠的DNA配制陰性對照PCR反應體系:25μl的陰性對照PCR反應體系為含有成分如下:DEPC水,15.75μl;10×PCRbuffer,2.5μl;10mM?dNTPs,0.5μl;1.25U?Tag?DNA聚合酶,0.25μl;300nM正向引物(PrimerF),2.5μl;300nM反向引物(PrimerR),2.5μl;未感染MCMV小鼠的DNA,1μl;
利用感染小鼠巨細胞病毒小鼠的DNA制備陽性對照PCR反應體系:25μl的陽性對照PCR反應體系為含有成分如下:DEPC水,15.75μl;10×PCRbuffer,2.5μl;10mM?dNTPs,0.5μl;1.25U?Tag?DNA聚合酶,0.25μl;300nM正向引物(PrimerF),2.5μl;300nM反向引物(PrimerR),2.5μl;感染MCMV小鼠的DNA,1μl;
(2)循環反應:
按照步驟(1)中的PCR反應體系加樣,將加好樣的PCR試劑管放入熒光PCR儀中,設置相應的熒光采集條件后進行擴增,反應循環程序為:(a)、95℃預變性5min,1個循環;(b)、95℃變性20sec,55℃退火30sec,72℃延伸30sec,40個循環后反應結束,得到反應產物;
(3)有效性驗證:
熒光PCR儀采集熒光信號,經計算機軟件生成陰性對照點和陽性對照點;陰性對照應無CT值并且無擴增曲線,陽性對照點應位于標準曲線上,并且其CT值應<30,否則重做。
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