[發(fā)明專利]11個用于預測原發(fā)性肝癌是否轉移的microRNA標志物無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 200910194813.8 | 申請日: | 2009-08-31 |
| 公開(公告)號: | CN102002492A | 公開(公告)日: | 2011-04-06 |
| 發(fā)明(設計)人: | 何祥火;魏霖;梁琳慧;顧健人 | 申請(專利權)人: | 上海市腫瘤研究所 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12N15/63;C12Q1/68;C40B40/06 |
| 代理公司: | 上海專利商標事務所有限公司 31100 | 代理人: | 徐迅 |
| 地址: | 200032 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 11 用于 預測 原發(fā)性 肝癌 是否 轉移 microrna 標志 | ||
技術領域
本發(fā)明涉及生物技術領域,更具體地,本發(fā)明涉及一類可用于預測原發(fā)性肝癌是否轉移的microRNA標志物以及用途。本發(fā)明還涉及檢測所述microRNA標志物的芯片和試劑盒。
背景技術
原發(fā)性肝癌是我國最常見的惡性腫瘤之一,每年新發(fā)病例約占全球50%。肝癌的惡性程度高,發(fā)展迅速,治療困難,病死率高。因此,肝癌的盡早診斷就愈發(fā)顯得迫切。
任何事物的發(fā)生發(fā)展都處于內(nèi)外因共同作用之下,內(nèi)因為主,外因為輔。基因作為生命的遺傳介質(zhì),在生物體的生、老、病、死中處于基礎內(nèi)因的地位。絕大部分基因通過轉錄生成核糖核酸,再翻譯生成蛋白質(zhì)而發(fā)揮生物學功能。
microRNA(miR或miRNA,微小RNA)是一類在較高等的真核生物體內(nèi)廣泛存在的,長度約18-26個堿基的單鏈RNA分子。它可以通過堿基配對原則特異性地與一些mRNA上的靶位點相結合,引起靶mRNA降解或翻譯抑制,進而在轉錄后水平對靶基因進行調(diào)控。
microRNA來源于長度約為1000bp的長鏈RNA初始轉錄產(chǎn)物(Pri-miRNA),Pri-miRNA分子在細胞核中經(jīng)Drosha酶剪切形成長度約60~80nt的具有莖環(huán)結構的miRNA前體(Pre-miRNA)。Pre-miRNA轉運至胞質(zhì)后,被Dicer酶進一步切割成長約22nt的雙鏈miRNA。雙鏈miRNA解開后,成熟的miRNA進入RNA誘導基因沉默復合物(RNA-induced?silencing?complex,RISC),與互補mRNA完全或不完全配對,降解靶mRNA或阻遏其表達。
盡管microRNA在細胞總RNA中所占的比重很小,但由于它可以高效地對所有具有靶位點的mRNA產(chǎn)生調(diào)控作用,microRNA在生物體的發(fā)育乃至腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程所起的作用仍不可小視。
然而,迄今為止,本領域?qū)τ谂c腫瘤(如肝癌)相關的microRNA了解甚少,因此本領域迫切需要進一步地分離各種microRNA,尤其是與腫瘤的發(fā)生、轉移、復發(fā)或檢測有關的microRNA。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的就是提供一類新的、可用于預測原發(fā)性肝癌是否轉移的microRNA標志物。
本發(fā)明的另一目的就是提供所述microRNA標志物的用途。
在本發(fā)明的第一方面,提供了一種分離的miRNA,所述的miRNA選自:
(i)序列如SEQ?ID?NO:n所示的miRNA,其中n為選自1-11的正整數(shù);或
(ii)與SEQ?ID?NO:n所示序列互補的miRNA。
在另一優(yōu)選例中,所述的miRNA分離自人。
在本發(fā)明的第二方面,提供了一種miRNA集(set)或組合(combination),所述的集或組合由序列如SEQ?ID?NO:1-11所示的11種miRNA所構成。
在本發(fā)明的第三方面,提供了一種分離的或人工構建的前體miRNA,所述的前體miRNA能在人細胞內(nèi)剪切并表達成本發(fā)明第一方面中所述的miRNA。
在本發(fā)明的第四方面,提供了一種分離的多核苷酸,所述的多核苷酸能被人細胞轉錄成前體miRNA,所述的前體miRNA能在人細胞內(nèi)被剪切且表達成本發(fā)明第一方面中所述的miRNA。
在另一優(yōu)選例中,所述的多核苷酸具有式I所示的結構:
Seq正向-X-Seq反向????式I,
式I中,
Seq正向為能在人細胞中表達成所述的miRNA的核苷酸序列,
Seq反向為與Seq正向基本上互補或完全互補的核苷酸序列;
X為位于Seq正向和Seq反向之間的間隔序列,并且所述間隔序列與Seq正向和Seq反向不互補,
并且式I所示的結構在轉入人細胞后,形成式II所示的二級結構:
式II,
式II中,Seq正向、Seq反向和X的定義如上述,
||表示在Seq正向和Seq反向之間形成的堿基互補配對關系。
在本發(fā)明的第五方面,提供了一種載體,它含有本發(fā)明第一方面中所述的miRNA,或第四方面中所述的多核苷酸。
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