[發(fā)明專利]日本囊對(duì)蝦線粒體cytb基因片段PCR擴(kuò)增引物及鑒別方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 200910179697.2 | 申請(qǐng)日: | 2009-10-20 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN101693919A | 公開(kāi)(公告)日: | 2010-04-14 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 徐田軍;王日昕;孟繁星;石戈 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 浙江海洋學(xué)院 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 杭州杭誠(chéng)專利事務(wù)所有限公司 33109 | 代理人: | 尉偉敏 |
| 地址: | 316000 浙*** | 國(guó)省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 日本 對(duì)蝦 線粒體 cytb 基因 片段 pcr 擴(kuò)增 引物 鑒別方法 | ||
1.日本囊對(duì)蝦線粒體cytb基因片段PCR擴(kuò)增引物,其特征在于,所述擴(kuò)增引物為一對(duì),分別為SEQ?No.1或SEQ?No.2所示的核苷酸序列。
2.日本囊對(duì)蝦福建群體的鑒別方法,其特征在于,所述方法步驟如下:
(1)利用權(quán)利要求1所述的一對(duì)擴(kuò)增引物對(duì)待測(cè)樣品的線粒體DNA中細(xì)胞色素b基因片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
(2)擴(kuò)增產(chǎn)物純化后測(cè)序,其中,核苷酸序列第528位和第534位堿基為G的待測(cè)樣品來(lái)自福建群體。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的鑒別方法,其特征在于,所述步驟(1)中的待測(cè)樣品選自廣東群體、臺(tái)灣群體、浙江群體和福建群體。
4.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的鑒別方法,其特征在于,所述步驟(1)中PCR擴(kuò)增的條件為:94℃預(yù)變性4min,94℃變性30sec,50℃退火45sec,72℃延伸45sec;經(jīng)30個(gè)循環(huán)后再在72℃延伸7min。
5.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的鑒別方法,其特征在于,所述步驟(1)中PCR擴(kuò)增的反應(yīng)體系組成為:0.2ml?PCR薄壁管中加入以下組分:10×Buffer?5μL,dNTP各0.2mmol/L,一對(duì)擴(kuò)增引物各0.2μmol/L,Taq?plus?DNA聚合酶2U,DNA模板50-100ng,最后用滅菌的雙蒸水補(bǔ)至50μL。
6.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的鑒別方法,其特征在于,所述步驟(2)中的擴(kuò)增產(chǎn)物純化采用膠回收試劑盒。
7.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的鑒別方法,其特征在于,所述步驟(2)中的測(cè)序采用自動(dòng)測(cè)序儀進(jìn)行雙向測(cè)序。
8.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的鑒別方法,其特征在于,所述步驟(2)中的擴(kuò)增產(chǎn)物序列經(jīng)比對(duì)剪切后分析長(zhǎng)度為552bp。
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