[發明專利]鑒別香菇菌種241和241-4的分子特異性標記引物及檢測方法無效
| 申請號: | 200910154923.1 | 申請日: | 2009-11-30 |
| 公開(公告)號: | CN101712984A | 公開(公告)日: | 2010-05-26 |
| 發明(設計)人: | 李海波;吳學謙;付立忠;魏海龍;吳慶其;賀亮;程俊文 | 申請(專利權)人: | 浙江省林業科學研究院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 杭州天正專利事務所有限公司 33201 | 代理人: | 黃美娟;冷紅梅 |
| 地址: | 310023 浙江省*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 鑒別 香菇 菌種 241 分子 特異性 標記 引物 檢測 方法 | ||
(一)技術領域
本發明涉及一種可區別香菇生產近緣種241和241-4的分子特異性標 記引物,以及利用該引物對香菇生產菌種241和241-4進行區別和鑒定的 方法。
(二)背景技術
香菇Lentinula?edodes(Berk.)Pegler因其美味和具有重要的食、藥用 價值而倍受國內外消費者的喜愛,是我國商業化生產規模最大和世界上產 量僅次于雙孢蘑菇的食用菌。中國是最早栽培香菇的國家,目前香菇產量 達到全世界的70%。
香菇菌種是香菇生產中最重要的生產資料,目前在中國商業化栽培使 用的香菇菌種已超過100余種。不同的香菇菌種具有不同的生產性狀和商 業利用價值,因而菌種的快速準確鑒定對于香菇產業的發展至關重要。香 菇菌種鑒定的經典方法主要是通過對香菇菌絲、菌落和子實體形態的宏觀 現察、生長特性、生理生化反應以及不同菌株間發生的拮抗反應等。這些 方法由于易受環境因素和生理狀況的影響,對形態特征上差異較小的菌株 尤其是一些香菇近緣種例如241與241-4,Cr02與Cr04,申香2號、 申香4號與申香6號,939-9與939-6等難以實現快速準確的鑒別。
此外,由于香菇菌種本身具有無性繁殖的遺傳特性,使得在菌種市場 上同種異名,異種同名、假種、劣種現象普遍存在,再加上菌種質量的退 化現象,不僅極大地損害了香菇生產者和育種者的利益,也極大地影響了 我國食用菌產業的持續健康發展。因此,建立起一套科學可靠、快速便捷 的香菇菌種鑒定體系,不僅有利于我國香菇種質資源的發掘與利用,更好 地為選育具有我國自主知識產權的優良香菇菌種服務,而且也是規范現階 段混亂的香菇菌種市場、促進香菇產業持續健康發展的迫切需要。
分子生物學技術的快速發展,特別是分子標記和基因標記技術的建立 與成熟,為發展簡便、快速、準確的菌株鑒定技術提供了有效手段。SCAR (特征性片段擴增區域)標記是1993年由Paran和Michelmore在RAPD 基礎上提出的,它基于對特異RAPD片段的測序,根據兩端序列設計一 對18~24堿基的引物,在較高的退火溫度下進行特異擴增實現的,其專 一性引物的采用排除了隨機引物結合位點之間的競爭,因而它是一種十分 穩定的分子標記,在應用上具有迅速、簡便、低成本的特點。
(三)發明內容
本發明目的是提供一種可區別香菇生產近緣種241和241-4的分子特 異性標記引物,以及一種利用該引物對香菇生產菌種241和241-4進行快 速辨別的方法。
本發明采用的技術方案是:
一種鑒別香菇生產菌種241和241-4的分子特異性標記引物,所述引 物序列為:
上游引物:5′-GGTTCTGCTCCTTGTGACTG-3′
下游引物:5′-TCTGCTCTTCAGATGCAAGCT-3′
該引物對是采用PCR技術,經過大量篩選試驗,采用RAPD標記獲 得香菇241和241-4菌種的差異DNA片段,將該片段克隆測序,以得到 DNA序列為基礎設計特異性引物。以該引物對對香菇241和241-4菌種 進行PCR擴增,可從241菌種中獲得1609bp大小的特異性片段。
本發明還涉及一種利用所述分子特異性標記引物對香菇生產菌種 241和241-4進行快速鑒別的方法,所述方法包括:提取待測香菇菌種基 因組DNA作為模板,以所述分子特異性標記引物作為擴增引物,進行PCR 擴增,對擴增產物進行電泳檢測,若電泳結果出現1609bp的DNA條帶, 則待測菌種為香菇241菌種,若電泳結果未出現1609bp的DNA條帶, 則待測菌種為香菇241-4菌種;所述分子特異性標記引物序列為:
上游引物5′-GGTTCTGCTCCTTGTGACTG-3′
下游引物5′-TCTGCTCTTCAGATGCAAGCT-3′
所述方法關鍵在于擴增引物的選擇、DNA提取、PCR反應體系及反 應條件確定,以及電泳檢測,均可按照本領域常規方法進行。
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