[發(fā)明專(zhuān)利]檢測(cè)前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大相關(guān)基因SLC26A4的349delC突變的試劑盒

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 200710301660.3
• 申請(qǐng)日: 2005-08-08
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN101255471A
• 公開(kāi)（公告）日: 2008-09-03
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 王秋菊;沈巖;翟所強(qiáng);趙亞麗
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 中國(guó)人民解放軍總醫(yī)院;北京諾賽基因組研究中心有限公司
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/68
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京律誠(chéng)同業(yè)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司
• 代理人: 黃韌敏

本申請(qǐng)是中國(guó)專(zhuān)利申請(qǐng)200510087749.5的分案申請(qǐng)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及用于檢測(cè)SLC26A4突變基因的試劑盒。

背景技術(shù)

SLC26A4基因位于7q31，其最初是由Everett等定位，并且發(fā)現(xiàn)該基因突變可以導(dǎo)致一種常染色體隱性遺傳性疾病：Pendred綜合征，臨床表現(xiàn)為甲狀腺腫，及合并前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大或Mondini畸形(前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大合并耳蝸發(fā)育不全)的感音神經(jīng)性耳聾。后來(lái)，Usami等對(duì)6例單純前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大家系的SLC26A4基因的篩查結(jié)果表明，該基因的突變還可以導(dǎo)致單純前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大，其遺傳模式也是隱性遺傳.由此可見(jiàn)，SLC26A4基因突變可以導(dǎo)致前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大——單純性前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大或者是合并耳蝸畸形的前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大。前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大是內(nèi)耳最常見(jiàn)的畸形，其在遺傳性耳聾中占到1～8％。臨床上主要表現(xiàn)為高頻聽(tīng)力損失為主的感音神經(jīng)性耳聾，聽(tīng)力損失程度多表現(xiàn)為重度或者是極重度聾。發(fā)病多在兒童時(shí)期，其發(fā)病前常有感冒、發(fā)燒、外傷等使顱內(nèi)壓增高的誘因。

與前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大相關(guān)的SLC26A4基因mRNA全長(zhǎng)4930bp，含21個(gè)外顯子，開(kāi)放閱讀框架2343bp，貫穿外顯子2和外顯子21。該基因編碼的蛋白——Pendrin是一個(gè)分子量為86kD，含780個(gè)氨基酸的跨膜蛋白，屬于離子轉(zhuǎn)運(yùn)子家族。Scott和Bidart等的研究發(fā)現(xiàn)，Pendrin主要表達(dá)于甲狀腺濾泡細(xì)胞的頂膜及內(nèi)淋巴管和內(nèi)淋巴囊的主細(xì)胞，介導(dǎo)碘離子和氯離子的轉(zhuǎn)運(yùn)，在維持甲狀腺組織和內(nèi)淋巴的離子平衡上發(fā)揮作用。在甲狀腺，當(dāng)Pendrin功能障礙時(shí)，其不能把碘離子及時(shí)轉(zhuǎn)運(yùn)到濾泡膠質(zhì)，使碘離子在濾泡細(xì)胞內(nèi)積聚，從而不能有效有機(jī)化并與甲狀腺球蛋白結(jié)合，從而導(dǎo)致Pendred綜合征中甲狀腺腫的發(fā)生。Qvortrup等認(rèn)為，大鼠的內(nèi)淋巴囊類(lèi)似甲狀腺濾泡，有平衡膠狀物質(zhì)填塞囊腔，內(nèi)淋巴囊主細(xì)胞的功能類(lèi)似于甲狀腺濾泡細(xì)胞，可以合成、分泌、吸收、消化蛋白質(zhì)。氯離子轉(zhuǎn)運(yùn)障礙使內(nèi)淋巴液的成分改變，從而損傷感覺(jué)上皮細(xì)胞，導(dǎo)致感音神經(jīng)性耳聾。并且由于滲透壓改變和成分改變的毒性機(jī)制導(dǎo)致膜迷路結(jié)構(gòu)改變。由于內(nèi)淋巴管和內(nèi)淋巴囊到4歲時(shí)才停止發(fā)育，因此它們的擴(kuò)大可以導(dǎo)致周?chē)切越Y(jié)構(gòu)的改變，例如前庭導(dǎo)水管或耳蝸結(jié)構(gòu)的改變。

對(duì)于前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大患者SLC26A4基因突變的篩查，國(guó)外已經(jīng)廣泛開(kāi)展，報(bào)道的致病突變位點(diǎn)超過(guò)100個(gè)，包括錯(cuò)義突變、框移突變、無(wú)義突變及剪接位點(diǎn)突變，分布于各個(gè)外顯子。SLC26A4基因具有明顯的異質(zhì)性，不同種族其突變形式不完全相同。該基因突變后其編碼的蛋白不能準(zhǔn)確定位到細(xì)胞膜上，而是存在于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或者是高爾基體內(nèi)，影響離子轉(zhuǎn)運(yùn)。

前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大患者SLC26A4基因突變的發(fā)現(xiàn)，不僅會(huì)促進(jìn)該病的發(fā)病機(jī)理等基礎(chǔ)研究的發(fā)展，還將大大促進(jìn)前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大的基因診斷和治療的開(kāi)展。通過(guò)產(chǎn)前診斷篩查及新生兒SLC26A4基因突變的普遍篩查，可以降低前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大患兒的出生率，并且實(shí)現(xiàn)癥前診斷，從而指導(dǎo)攜帶致病基因的患兒的行為，預(yù)防疾病的發(fā)生，這將會(huì)大大減少耳聾患者的數(shù)量，減輕社會(huì)壓力。未來(lái)的研究將致力于基因治療方面，能夠預(yù)見(jiàn)，基因治療將會(huì)給包括耳聾在內(nèi)的各種遺傳性疾病的治療帶來(lái)質(zhì)的飛躍。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于提供用于檢測(cè)來(lái)自待測(cè)個(gè)體的樣本是否存在SLC26A4基因突變的試劑盒。

根據(jù)本發(fā)明的一方面，本發(fā)明提供了一種與前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大疾病相關(guān)基因的檢測(cè)方法。該檢測(cè)方法通過(guò)檢測(cè)來(lái)自待測(cè)個(gè)體的樣本中是否存在SLC26A4基因突變，而診斷該待測(cè)個(gè)體中前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大疾病的發(fā)生和類(lèi)型，其中所述的SLC26A4基因突變?yōu)槲挥赟LC26A4基因外顯子4的349delC雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子7的916?917insG雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子3的230A＞T雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子15的1673A＞T雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子11的1336C＞T雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子14的1594A＞C雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子12的1343C＞A雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子11的1318A＞T雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子8的946G＞T雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子17的1975G＞C雜合突變或位于SLC26A4基因外顯子6的626G＞A突變。

所述檢測(cè)方法可包括下述步驟：

1)采集待測(cè)個(gè)體的血液、體液或組織樣本，提取DNA；