[發明專利]檢測前庭導水管擴大相關基因SLC26A4的230A＞T突變的試劑盒

有效

• 申請號: 200710301658.6
• 申請日: 2005-08-08
• 公開（公告）號: CN101255469A
• 公開（公告）日: 2008-09-03
• 發明（設計）人: 王秋菊;沈巖;翟所強;趙亞麗
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍總醫院;北京諾賽基因組研究中心有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京律誠同業知識產權代理有限公司
• 代理人: 黃韌敏

本申請是中國專利申請CN200510087749.5的分案申請。

技術領域

本發明涉及用于檢測SLC26A4突變基因的試劑盒。

背景技術

SLC26A4基因位于7q31，其最初是由Everett等定位，并且發現該基因突變可以導致一種常染色體隱性遺傳性疾病：Pendred綜合征，臨床表現為甲狀腺腫，及合并前庭導水管擴大或Mondini畸形(前庭導水管擴大合并耳蝸發育不全)的感音神經性耳聾。后來，Usami等對6例單純前庭導水管擴大家系的SLC26A4基因的篩查結果表明，該基因的突變還可以導致單純前庭導水管擴大，其遺傳模式也是隱性遺傳.由此可見，SLC26A4基因突變可以導致前庭導水管擴大——單純性前庭導水管擴大或者是合并耳蝸畸形的前庭導水管擴大。前庭導水管擴大是內耳最常見的畸形，其在遺傳性耳聾中占到1～8％。臨床上主要表現為高頻聽力損失為主的感音神經性耳聾，聽力損失程度多表現為重度或者是極重度聾。發病多在兒童時期，其發病前常有感冒、發燒、外傷等使顱內壓增高的誘因。

與前庭導水管擴大相關的SLC26A4基因mRNA全長4930bp，含21個外顯子，開放閱讀框架2343bp，貫穿外顯子2和外顯子21。該基因編碼的蛋白——Pendrin是一個分子量為86kD，含780個氨基酸的跨膜蛋白，屬于離子轉運子家族。Scott和Bidart等的研究發現，Pendrin主要表達于甲狀腺濾泡細胞的頂膜及內淋巴管和內淋巴囊的主細胞，介導碘離子和氯離子的轉運，在維持甲狀腺組織和內淋巴的離子平衡上發揮作用。在甲狀腺，當Pendrin功能障礙時，其不能把碘離子及時轉運到濾泡膠質，使碘離子在濾泡細胞內積聚，從而不能有效有機化并與甲狀腺球蛋白結合，從而導致Pendred綜合征中甲狀腺腫的發生。Qvortrup等認為，大鼠的內淋巴囊類似甲狀腺濾泡，有平衡膠狀物質填塞囊腔，內淋巴囊主細胞的功能類似于甲狀腺濾泡細胞，可以合成、分泌、吸收、消化蛋白質。氯離子轉運障礙使內淋巴液的成分改變，從而損傷感覺上皮細胞，導致感音神經性耳聾。并且由于滲透壓改變和成分改變的毒性機制導致膜迷路結構改變。由于內淋巴管和內淋巴囊到4歲時才停止發育，因此它們的擴大可以導致周圍骨性結構的改變，例如前庭導水管或耳蝸結構的改變。

對于前庭導水管擴大患者SLC26A4基因突變的篩查，國外已經廣泛開展，報道的致病突變位點超過100個，包括錯義突變、框移突變、無義突變及剪接位點突變，分布于各個外顯子。SLC26A4基因具有明顯的異質性，不同種族其突變形式不完全相同。該基因突變后其編碼的蛋白不能準確定位到細胞膜上，而是存在于內質網或者是高爾基體內，影響離子轉運。

前庭導水管擴大患者SLC26A4基因突變的發現，不僅會促進該病的發病機理等基礎研究的發展，還將大大促進前庭導水管擴大的基因診斷和治療的開展。通過產前診斷篩查及新生兒SLC26A4基因突變的普遍篩查，可以降低前庭導水管擴大患兒的出生率，并且實現癥前診斷，從而指導攜帶致病基因的患兒的行為，預防疾病的發生，這將會大大減少耳聾患者的數量，減輕社會壓力。未來的研究將致力于基因治療方面，能夠預見，基因治療將會給包括耳聾在內的各種遺傳性疾病的治療帶來質的飛躍。

發明內容

本發明的目的在于提供用于檢測來自待測個體的樣本是否存在SLC26A4基因突變的試劑盒。

根據本發明的一方面，本發明提供了一種與前庭導水管擴大疾病相關基因的檢測方法。該檢測方法通過檢測來自待測個體的樣本中是否存在SLC26A4基因突變，而診斷該待測個體中前庭導水管擴大疾病的發生和類型，其中所述的SLC26A4基因突變為位于SLC26A4基因外顯子4的349delC雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子7的916_917insG雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子3的230A＞T雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子15的1673A＞T雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子11的1336C＞T雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子14的1594A＞C雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子12的1343C＞A雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子11的1318A＞T雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子8的946G＞T雜合突變、位于SLC26A4基因外顯子17的1975G＞C雜合突變或位于SLC26A4基因外顯子6的626G＞A突變。

所述檢測方法可包括下述步驟：

1)采集待測個體的血液、體液或組織樣本，提取DNA；