[發(fā)明專利]與黃斑變性相關(guān)的基因

無效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 200680046343.5
• 申請(qǐng)日: 2006-10-11
• 公開（公告）號(hào): CN101331235A
• 公開（公告）日: 2008-12-24
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 約瑟芬·赫
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 耶魯大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68
• 代理公司: 北京集佳知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司
• 代理人: 劉曉東;彭鯤鵬

資助

本發(fā)明在來自國立衛(wèi)生研究院的基金號(hào)HG000060和基金號(hào) EY015771下由美國政府支持進(jìn)行的。美國政府擁有本發(fā)明的某些權(quán)利。 交叉引用相關(guān)申請(qǐng)

本申請(qǐng)要求2005年10月11日提交的美國臨時(shí)申請(qǐng)?zhí)?0/726,061 的權(quán)益。該引用臨時(shí)申請(qǐng)的教導(dǎo)以其全部通過引用并入本文。

背景技術(shù)

年齡相關(guān)黃斑變性(age-related?macular?degeneration，AMD)是發(fā) 達(dá)國家老年人中失明的首要原因。其發(fā)生率隨壽命的增長和老年群體的 擴(kuò)大而增加(D.S.Friedman等人，Arch?Ophthalmol?122，564(2004))。它 是一種慢性疾病，其特征在于視網(wǎng)膜中央?yún)^(qū)(黃斑)的進(jìn)行性破壞，從而 導(dǎo)致中央視野喪失(J.Tuo，C.M.Bojanowski，C.C.Chan，Prog?Retin Eye?Res?23，229(2004))。AMD的一個(gè)極重要的特征是形成了稱為玻璃 疣(drusen)的細(xì)胞外沉積物，所述玻璃疣集中在視網(wǎng)膜色素上皮(RPE) 和脈絡(luò)膜之間視網(wǎng)膜后面的黃斑之中和其周圍。發(fā)生AMD的風(fēng)險(xiǎn)由遺 傳變體(genetic?variant)的復(fù)雜相互作用確定，其中許多變體迄今尚 未鑒定。關(guān)于AMD的遺傳決定子(genetic?determinant)的額外信息 對(duì)于本領(lǐng)域?qū)⑹菢O具價(jià)值的。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明涉及對(duì)與AMD易感性相關(guān)的人基因中變異的鑒定。此類變 異和其中發(fā)生所述變異的變異基因可用于鑒定或輔助鑒定有發(fā)生AMD 風(fēng)險(xiǎn)的個(gè)體以及診斷或輔助診斷AMD。本發(fā)明還涉及用于鑒定或輔助 鑒定有發(fā)生AMD風(fēng)險(xiǎn)的個(gè)體的方法、用于診斷或輔助診斷AMD的方 法、用于所述方法的多核苷酸(例如，探針、引物)、包含探針或引物 的診斷試劑盒、治療有AMD風(fēng)險(xiǎn)或患AMD的個(gè)體的方法以及用于治 療有AMD風(fēng)險(xiǎn)或患AMD的個(gè)體的組合物。

申請(qǐng)人分析來自具有AMD的個(gè)體和不具有AMD的個(gè)體(對(duì)照) 的全基因組SNP基因分型數(shù)據(jù)并尋找LOC387715以及顯示出相互作用 的其它基因座處的單關(guān)聯(lián)性(single?association)。在基因LOC387715中 發(fā)現(xiàn)了已知在發(fā)生AMD的風(fēng)險(xiǎn)中起作用的一個(gè)變體。如此處所描述的， 申請(qǐng)人證實(shí)了LOC387115和AMD之間的關(guān)聯(lián)性。此外，他們提供了 基因LOC387715的變體、突觸孔蛋白(synaptoporin，SYNPR)和血小 板衍生生長因子C(platelet-derived?growth?factor，PDGFC)(其全都位 于已知的AMD連鎖峰內(nèi))的相互作用促成了對(duì)AMD易感性的證據(jù)。 這些相互作用和申請(qǐng)人之前鑒定的補(bǔ)體因子H(CFH)關(guān)聯(lián)性一起似乎 解釋了AMD的相當(dāng)部分的遺傳風(fēng)險(xiǎn)。

在一個(gè)實(shí)施方案中，本發(fā)明提供了用于檢測或輔助檢測與人中發(fā)生 AMD相關(guān)的LOC387715基因、與人中發(fā)生AMD相關(guān)的SYNPR基因 以及與人中發(fā)生AMD相關(guān)的PDGFC基因的多核苷酸。術(shù)語“與人中 發(fā)生AMD相關(guān)”和“與發(fā)生AMD相關(guān)”在此處可互換使用。在一些 特定的實(shí)施方案中，本發(fā)明涉及用于檢測或輔助檢測與人中AMD相關(guān) 的各基因中的變異的多核苷酸。在另一個(gè)實(shí)施方案中，本發(fā)明提供了用 于鑒定或輔助鑒定有發(fā)生AMD風(fēng)險(xiǎn)的個(gè)體的方法和組合物。在另一些 實(shí)施方案中，本發(fā)明的方法和組合物可用于治療患AMD或有發(fā)生AMD 風(fēng)險(xiǎn)的個(gè)體。本發(fā)明的另一主題是用于單獨(dú)地或組合地檢測來自個(gè)體的 樣品中的變異LOC387715基因、變異SYNPR基因和/或變異PDGFC 基因的診斷試劑盒。此類試劑盒還可用于檢測包含CFH基因中與發(fā)生 AMD相關(guān)之變異的變異CFH基因。此類試劑盒可用于鑒定或輔助鑒定 有發(fā)生AMD之風(fēng)險(xiǎn)的個(gè)體和用于診斷或輔助診斷個(gè)體中的AMD。

在一些特定的實(shí)施方案中，本發(fā)明提供了用于檢測變異LOC387715 基因的分離多核苷酸；用于檢測變異SYNPR基因的分離多核苷酸；和 用于檢測變異PDGFC基因的分離多核苷酸。所述分離的多核苷酸包括 特異性檢測LOC387715基因中的與人AMD相關(guān)的變異、SYNPR基因 中與人AMD相關(guān)的變異或PDGFC基因中與人發(fā)生AMD相關(guān)的變異 的核酸分子。分離的多核苷酸可用于在來自個(gè)體的樣品中檢測與人中 AMD相關(guān)的變異LOC387715基因、變異SYNPR基因或變異PDGFC 基因。