[發明專利]一種與青海八眉豬產仔數性狀相關的SNP分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202010414932.6
• 申請日: 2020-05-15
• 公開（公告）號: CN111676293B
• 公開（公告）日: 2023-06-20
• 發明（設計）人: 吳國芳;王磊;吳森;馬玉紅
• 申請（專利權）人: 青海省畜牧獸醫科學院
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 焦作加貝專利代理事務所(普通合伙) 41182
• 代理人: 任昕

本發明公開了一種與青海八眉豬產仔數性狀相關的SNP分子標記，屬于分子育種技術領域。所述SNP分子標記的SNP位點位于DRD1基因第1159位，且該處堿基是C、T或G中的一種，其中，所述DRD1基因的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示。利用本發明的分子標記和方法，可以利用DRD1可作為候選基因，在此群體的選育和實際生產中可利用，為青海八眉豬的分子標記輔助選擇提供理論參考。

技術領域

本發明屬于分子育種技術領域，具體地，涉及一種與青海八眉豬產仔數性狀相關的SNP分子標記及其應用。

背景技術

多巴胺受體1(DRD1，dopamine?receptor?D1)是一種典型的G蛋白偶聯受體，在胚胎早期發育起著決定性作用，特別是神經干細胞的發育。DRD1在鵝的心、腎、腸、肌肉、脂肪、垂體、下丘腦、子宮、輸卵管等組織廣泛表達。哥倫比亞人DRD1區域(rs686、rs1039089)的多態性可能引起抑郁癥。一定的光刺激可以引起DRD1在神經細胞中表達量上升，從而抑制抑郁行為。而內側杏仁核中DRD1水平的變化可以引起草原田鼠性行為變化。DRD1?rs4532區域的多態性與亞洲人和非洲人的原發性高血壓相關。在通過GWAS研究蛋雞胚胎發育相關研究中，發現DRD1的SNPs可能與蛋雞的蛋品質有關，敲除DRD1等基因后雞的攻擊性行為顯著降低。DRD1?G123A的SNP與匈牙利黃雞的體重、蛋品質有關。肉雞DRD1?C201T、A208G、A255G處的SNP與性成熟顯著相關，G1073A與300日產蛋量、首次就巢日齡顯著相關。櫻桃谷鴨、興義鴨DRD1?T189C、T507A的SNP與體重、體斜長、胸深等性狀顯著相關，且與血清總蛋白、球蛋白、白蛋白、白/球比、低密度脂蛋白及肌胸pH_24h和剪切力顯著相關。

青海八眉豬作為八眉豬的高原類群，具有產仔數高，母性好的優點，而關于DRD1和豬尤其是青海八眉豬相關生產性狀的研究少見報道。

發明內容

為了解決上述技術問題，發明人運用現代生物技術對豬DRD1基因進行多方位功能分析，檢測青海八眉豬DRD1所有外顯子片段的SNPs，并將其與相關生產、繁殖性狀進行了關聯分析，在DRD1基因外顯子區域意外地發現1個SNP與產仔數性狀有關，可以為青海八眉豬的分子輔助選育工作提供參考，從而完成本發明。

發明第一方面提供一種與青海八眉豬產仔數性狀相關的SNP分子標記，所述SNP分子標記的SNP位點位于DRD1基因第1159位，且該處堿基是C、T或G中的一種，其中，所述DRD1基因的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示。

DRD1基因定位于豬第16號染色體，全長4168bp，包含兩個外顯子區域，參考序列為GeneBank?No.:NC_010458.4(SEQ?ID?NO.1)。其蛋白(GeneBank?No.:NP_001116580.1)由446個氨基酸組成，存在糖基化和多個跨膜結構等功能性結構域。

本發明的第二方面提供檢測本發明第一方面所述的SNP分子標記的試劑在制備用于鑒定青海八眉豬產仔數性狀的試劑盒中的應用。

本發明的第三方面提供一種用于鑒定青海八眉豬產仔數性狀的試劑盒，包括能夠檢測本發明第一方面所述的SNP分子標記的試劑。

在本發明的一些實施方案中，所述試劑為能夠擴增所述SNP分子標記的引物組合。

在本發明的一些具體實施方案中，所述引物組合由具有SEQ?ID?NO.2所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQ?ID?NO.3所示核苷酸序列的下游引物組成。

本發明的第三方面提供一種選育產仔數多的青海八眉豬的方法，包括以下步驟：

(1)獲取青海八眉豬的基因組DNA；