[發明專利]轉錄組微陣列技術及應用該技術的方法

無效

• 申請號: 200580045774.5
• 申請日: 2005-11-03
• 公開（公告）號: CN101115848A
• 公開（公告）日: 2008-01-30
• 發明（設計）人: 保爾·哈金;帕特里克·約翰斯頓;卡爾·馬利根;奧斯汀·塔內
• 申請（專利權）人: 阿爾馬科診斷有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 隆天國際知識產權代理有限公司
• 代理人: 吳小瑛

1.包含患病組織轉錄組的陣列。

2.如權利要求1所述的陣列，其中所述患病組織包含患有腫瘤疾病、炎癥疾病或退行性疾病的組織。

3.如權利要求1所述的陣列，其中所述患病組織包含患有結腸直腸癌、肺癌、或乳腺癌的組織。

4.如權利要求1-3任一項所述的陣列，其中所述轉錄組包含一個或多個組織特異性元件，每個表示來自患病結腸直腸組織序列的轉錄物，每個所述的轉錄物獨立地選自基因列表B、基因列表C、基因列表D、基因列表E、基因列表F、基因列表G或基因列表H中所描述的轉錄物。

5.如權利要求1-3任一項所述的陣列，其中所述轉錄組包含一個或多個組織特異性元件，每個表示來自患病肺組織序列的轉錄物，每個所述的轉錄物獨立地選自基因列表J、基因列表K、基因列表L、基因列表M、基因列表N或基因列表O中所描述的轉錄物。

6.如權利要求1-3任一項所述的陣列，其中所述轉錄組包含一個或多個組織特異性元件，每個表示來自患病乳腺組織序列的轉錄物，每個所述的轉錄物獨立地選自基因列表Q、基因列表R、基因列表S、基因列表T、基因列表U或基因列表V中所描述的轉錄物。

7.如權利要求1-3任一項所述的陣列，其中所述轉錄組包含一個或多個組織特異性元件，每個表示來自患病肝組織序列的轉錄物，每個所述的轉錄物獨立地選自基因列表X、基因列表Y、基因列表Z、基因列表AA、基因列表BB或基因列表CC中所描述的轉錄物。

8.如權利要求1-3任一項所述的陣列，其中所述轉錄組包含一個或多個組織特異性元件，每個表示來自患病腦組織序列的轉錄物，每個所述的轉錄物獨立地選自基因列表EE、基因列表FF、基因列表GG、基因列表HH、基因列表II或基因列表JJ中所描述的轉錄物。

9.如權利要求1-3任一項所述的陣列，其中所述轉錄組包含一個或多個組織特異性元件，每個表示來自癌組織序列的轉錄物，每個所述的轉錄物獨立地選自基因列表B、C、D、E、F、G、H、J、K、L、M、N、O、Q、R、S、T、U或V中所描述的轉錄物。

10.如權利要求4-9任一項所述的陣列，其中所述轉錄組包含70％的表示至少一個所述基因列表中的轉錄物的組織特異性元件。

11.根據權利要求10所述的陣列，其中所述轉錄組包含70％的表示每個所述基因列表中的轉錄物的組織特異性元件。

12.根據權利要求4-11任一項所述的陣列，其中表示所述轉錄物的所述組織特異性元件是具有互補于所述轉錄物的序列的核酸分子。

13.根據權利要求4-11任一項所述的陣列，其中表示所述轉錄物的所述組織特異性元件是所述轉錄物編碼的多肽。

14.根據權利要求4-11任一項所述的陣列，其中表示所述轉錄物的所述組織特異性元件是特異于所述轉錄物編碼的多肽的抗體。

15.前述任一項權利要求所述的陣列，其中所述轉錄組包含來源于患病組織的編碼和非編碼轉錄物的核酸分子。

16.前述任一項權利要求所述的陣列在診斷患者病理狀況的方法中的用途，其包含：

a)將來自患者的生物樣品的轉錄物特異性元件與陣列接觸；和

b)檢測轉錄物特異性元件與陣列的結合；

其中結合的檢測指示病理狀況的診斷。

17.前述任一項權利要求所述的陣列在檢測已被診斷具有疾病或病癥的患者是否將在初步醫療干預后恢復或復發的方法中的用途。

18.前述任一項權利要求所述的陣列在檢測遭受病理狀況的患者對治療病理狀況的治療劑的反應性的方法中的用途，其包含：

a)將來自患者生物樣品的轉錄物特異性元件與陣列接觸；和

b)檢測陣列與轉錄物特異性元件的結合；

其中結合的檢測指示患者的病理狀況對治療劑的治療的反應性。

19.根據權利要求16、17或18所述的用途，當從屬于權利要求12時，其中，在步驟b中，結合的檢測是雜交的檢測。